明知是借用资质承包工程的合同，在法律上通常被认定为无效。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、法律依据与合同无效性
法律明确规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。资质借用行为直接违反了这一规定，因为建筑市场实行严格的资质管理制度，旨在确保工程质量和施工安全。
- 《中华人民共和国建筑法》第二十六条也明确指出，承包建筑工程的单位必须持有依法取得的资质证书，并在其资质等级许可的业务范围内承揽工程。禁止建筑施工企业以任何形式允许其他单位或者个人使用本企业的资质证书、营业执照，以本企业的名义承揽工程。
合同无效的原因：
- 资质借用合同之所以无效，是因为它破坏了建筑市场的准入制度，使得没有资质或资质不符的企业能够非法承揽工程。这不仅违反了法律的明确规定，也扰乱了市场的公平竞争秩序，增加了工程质量和安全风险。
二、合同无效后的处理与法律后果
合同无效的处理：
- 尽管合同无效，但如果建设工程经验收合格，承包人（实际施工人）可以请求参照合同关于工程价款的约定折价补偿。这是为了平衡各方利益，避免因合同无效而导致实际施工人投入的人力、物力无法得到合理回报。
- 如果建设工程经验收不合格，修复后验收合格的，发包人可以请求承包人承担修复费用；修复后仍验收不合格的，承包人无权请求折价补偿。
法律责任与处罚：
- 发包方明知承包方无资质仍与其签订合同，不仅合同无效，还可能面临法律责任和处罚，包括但不限于罚款、赔偿损失等。
- 此种行为损害了市场秩序和公共利益，相关部门可能会对此进行行政处罚，甚至可能引发刑事责任（如构成重大责任事故罪等）。
三、特殊情况与风险防范
特殊情况：
- 在极少数情况下，如果发包方对承包方借用资质的行为并不知情，且承包方具备实际施工能力，工程也经验收合格，那么发包方可能不会因合同无效而承担过重的法律责任。但这种情况非常罕见，且需要严格的证据支持。
风险防范：
- 谨慎审查：发包方在签订合同时，应当谨慎审查承包方的资质和信誉，确保承包方具备履行合同所需的能力和条件。
- 选择合规承包方：如果承包方不具备相应资质，发包方应当选择其他具备资质的承包方进行合作，以避免潜在的法律风险和纠纷。
- 法律咨询：在合同签订前，建议发包方咨询专业律师（即向我咨询），对合同条款及承包方资质进行法律评估，确保合同的合法性和有效性。
四、实例说明
假设甲无相应施工资质，却借用乙有资质的建筑施工企业名义与丙（发包方）签订建设工程施工合同。若丙明知甲无资质仍与其签订合同，且工程完工后经验收合格，尽管甲乙丙之间的施工合同因借用资质而无效，但甲仍有权请求参照合同约定的工程价款获得折价补偿。然而，丙作为发包方，可能因明知甲无资质而签订合同而面临法律责任和处罚。
综上所述，明知是借用资质承包工程的合同在法律上通常被认定为无效。为避免法律风险和经济损失，发包方应严格遵守相关法律法规，谨慎选择承包方，并在必要时寻求法律咨询。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。