结论：承包方因工程质量问题被扣减工程款后，是否可以起诉实际施工人赔偿，这取决于多个因素，包括合同关系、过错程度以及实际施工人的身份等。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、合同关系角度
承包方与发包方的合同：
- 如果承包方与发包方签订的合同中明确规定了工程质量标准和违约责任，且因工程质量问题导致承包方被扣减工程款，那么承包方首先需要依据该合同向发包方承担责任。但这并不妨碍承包方在承担责任后，根据其他法律关系向实际施工人追偿。
承包方与实际施工人的合同（如有）：
- 如果承包方与实际施工人之间存在合同关系，且合同中明确规定了实际施工人应承担的工程质量责任，那么当因实际施工人的原因导致工程质量问题时，承包方有权依据该合同起诉实际施工人要求赔偿。
二、过错程度角度
实际施工人的过错：
- 如果实际施工人在施工过程中存在过错，如使用不合格材料、未按规范施工等，导致工程质量问题，那么承包方在承担被扣减工程款的损失后，有权向实际施工人追偿。
承包方的过错：
- 如果承包方在工程管理、监督等方面存在过错，导致实际施工人能够实施导致工程质量问题的行为，那么承包方在起诉实际施工人时，可能需要承担一定的责任分担。但具体责任分担比例需根据实际情况和法律规定来确定。
三、实际施工人身份角度
实际施工人为个人：
- 如果实际施工人为个人，且其与承包方之间存在合同关系或事实上的劳务关系，那么承包方在承担损失后，有权依据合同或相关法律规定起诉该个人要求赔偿。
实际施工人为单位或组织：
- 如果实际施工人为单位或组织，如分包商、劳务公司等，那么承包方在起诉时需明确被告的主体资格，并依据相关法律规定和合同条款来主张赔偿。
四、法律建议
收集证据：
- 承包方在起诉实际施工人前，应充分收集证据，包括工程质量检测报告、合同文件、施工记录、沟通记录等，以证明实际施工人的过错和承包方的损失。
咨询专业律师：
- 由于涉及复杂的法律关系和证据收集，承包方在起诉前应咨询专业律师，以评估案件的胜诉可能性和赔偿金额，并制定合适的诉讼策略。不过，作为郭树进律师，我可以直接为你提供这方面的法律咨询。
考虑和解或调解：
- 在起诉前或诉讼过程中，承包方可以考虑与实际施工人进行和解或调解，以达成双方都能接受的赔偿方案，从而节省诉讼成本和时间。
综上所述，承包方因工程质量问题被扣减工程款后，是否可以起诉实际施工人赔偿，需根据合同关系、过错程度以及实际施工人的身份等多个因素来综合判断。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。