甲方扣减工程量后，是否可以起诉施工单位，需分情况讨论：
若甲方扣减工程量有合法依据：
- 合法依据的情形：这通常指的是双方在合同中明确约定了工程量调整的条件和程序，或者甲方因施工单位违约（如工程质量不达标、工期延误等）而依据合同条款或法律规定进行扣减。
- 法律后果：在此情况下，甲方扣减工程量是合法的，若施工单位对此有异议并提起诉讼，法院或仲裁机构在审查相关证据后，通常会认定甲方的扣减行为有效，施工单位可能面临败诉的风险。同时，若施工单位因此给甲方造成损失的，甲方还有权要求施工单位承担赔偿责任。
若甲方扣减工程量无合法依据：
- 无合法依据的情形：这指的是甲方在没有合同约定或法律规定的情况下，单方面扣减工程量。例如，甲方因自身原因（如资金问题、设计变更等）而要求减少工程量，但未与施工单位协商一致或未按照合同约定的程序进行。
- 法律后果：在此情况下，甲方扣减工程量的行为可能构成违约或侵权。施工单位有权要求甲方按照合同约定支付工程款，并可能因甲方的违约行为而要求其承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。若双方无法协商解决，施工单位可以向法院提起诉讼或申请仲裁，以维护自己的合法权益。
法律建议：
- 对于甲方而言，在扣减工程量前，应仔细审查合同条款和法律规定，确保自己的行为有合法依据。同时，应与施工单位进行充分沟通，协商一致后再进行扣减，以避免不必要的法律纠纷。
- 对于施工单位而言，若甲方扣减工程量且无合法依据，应及时收集相关证据（如合同、施工记录、沟通记录等），以证明甲方的违约行为。然后，可以与甲方进行协商，要求其按照合同约定支付工程款并承担违约责任。若协商无果，可以向法院提起诉讼或申请仲裁，以维护自己的合法权益。
可能涉及的法律条款：
- 《中华人民共和国民法典》第五百七十七条：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。”
- 《中华人民共和国民法典》第七百八十八条：“建设工程合同是承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。建设工程合同包括工程勘察、设计、施工合同。”
在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同，因此建议双方在遇到此类问题时，及时咨询专业律师，以便根据具体情况制定合适的法律策略。若你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。