即使公司已经向被辞退员工发放了工资，劳动仲裁机构或法院仍可能受理该员工的申诉，原因主要有以下几点：

1. 工资发放可能并非争议的全部：

   • 工资发放只是劳动关系中的一个方面，员工可能还对辞退的合法性、经济补偿、未签劳动合同的双倍工资、加班费、社保缴纳等其他方面存在争议。这些争议并不因工资的发放而自动解决。
   • 例如，员工可能认为公司辞退他的理由不合法，或者认为公司应支付额外的经济补偿，这些都需要通过劳动仲裁或诉讼来进一步确认和解决。

2. 工资发放可能存在争议：

   • 即使公司已经发放了工资，员工也可能对工资的数额、计算方式或发放时间等存在异议。这些争议同样需要通过法律途径来明确和解决。
   • 例如，员工可能认为公司少发了加班费或未按照约定支付奖金，这些都需要通过劳动仲裁或诉讼来维护自己的权益。

3. 法律程序的需要：

   • 劳动仲裁和诉讼是解决劳动争议的法定程序。即使双方已经就某些问题达成了一致，但如果员工认为自己的权益仍然受到了侵害，他仍然有权通过法律途径来寻求救济。
   • 劳动仲裁机构或法院在受理案件时，会审查员工的申诉请求和事实依据，如果认为存在争议且需要进一步审理，就会受理该案件。

4. 保护员工权益的立法目的：

   • 劳动法律法规的立法目的之一是保护劳动者的合法权益。因此，即使公司已经发放了工资，如果员工认为自己的其他权益受到了侵害，法律仍然鼓励他通过合法途径来维护自己的权益。

针对您的情况，我给出以下建议：

• 如果您是被辞退的员工，且认为公司除了工资发放外还存在其他违法行为或侵害您权益的行为，您可以向劳动仲裁机构或法院提起申诉或诉讼，以维护自己的合法权益。
• 如果您是公司方，且认为已经按照法律规定和劳动合同约定向员工支付了工资和其他待遇，但员工仍然提起申诉或诉讼，您可以积极应诉，并提供相关证据来证明自己的合法性和合规性。

最后，需要强调的是，劳动争议的处理需要遵循法定程序和法律规定。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。