核心结论：这种情况下的工伤责任认定和赔偿问题，需根据不同情形来确定责任主体，进而明确赔偿义务方，主要分为以下几种情况。

1. 若别的部门指点行为存在过错且与工伤有因果关系
   • 责任认定：根据《工伤保险条例》以及相关侵权责任法律规定，如果别的部门在指点过程中存在过错，比如指挥不当、提供错误操作方法等，并且这种过错行为与同事所遭受的工伤之间存在直接的因果关系，那么别的部门可能需要承担相应的责任。例如，别的部门指挥同事在危险区域进行不符合安全规范的操作，导致同事受伤，此时别的部门就存在过错。
   • 赔偿义务：在这种情况下，别的部门作为侵权方，应当承担侵权赔偿责任。同时，如果同事符合工伤认定的条件，即在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害等，也可以按照《工伤保险条例》的规定享受工伤保险待遇。这就出现了工伤保险赔偿和侵权赔偿竞合的情况，同事可以同时主张这两种赔偿，但其中一些项目如医疗费等不能重复获得赔偿。
2. 若别的部门指点行为不存在过错
   • 责任认定：如果别的部门的指点行为是合理的、符合操作规范和安全要求的，不存在任何过错，那么同事所遭受的工伤通常应认定为是在工作过程中因自身操作或者其他不可预见的原因导致的。例如，别的部门按照正常流程和安全标准进行指点，同事在操作过程中由于自己疏忽大意而受伤。
   • 赔偿义务：此时，同事应按照《工伤保险条例》的规定，由用人单位为其申请工伤认定，享受工伤保险待遇。用人单位如果依法为同事缴纳了工伤保险费，那么工伤保险基金将支付相应的工伤待遇，如医疗费用、一次性伤残补助金等；如果用人单位未依法缴纳工伤保险费，则由用人单位承担全部的工伤保险待遇赔偿责任。
3. 若难以确定别的部门指点行为与工伤的因果关系
   • 责任认定：在实际案例中，有时候很难清晰地判断别的部门的指点行为与同事工伤之间是否存在因果关系。这种情况下，可能需要通过专业的鉴定机构进行因果关系鉴定。例如，同事在维护设备过程中受伤，但受伤的原因比较复杂，既可能与设备本身的问题有关，也可能与别的部门的指点有关，还可能与同事自身的操作有关。
   • 赔偿义务：在鉴定结果出来之前，可以先按照工伤保险的程序进行处理，由用人单位为同事申请工伤认定。如果鉴定结果表明别的部门的指点行为与工伤存在因果关系，那么根据过错程度，别的部门可能需要承担相应的赔偿责任；如果鉴定结果表明不存在因果关系，则由工伤保险或者用人单位按照规定承担赔偿责任。

在处理这类问题时，建议及时收集和保留相关证据，如现场照片、证人证言、操作记录等，以便在后续的责任认定和赔偿协商中维护自己的合法权益。如果你还有其他关于工伤赔偿或者劳动法律方面的问题，可以直接向我咨询。