结论：公司扣钱且工资条上未体现，若该扣钱行为无正当理由，劳动者有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

一、法律依据

1. 《劳动法》第五十条：明确规定工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这为劳动者反对公司无故扣钱提供了直接的法律基础。
2. 《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条：规定中华人民共和国境内的用人单位与劳动者因劳动报酬等发生的争议，适用本法。这意味着，因公司扣钱引发的劳动报酬争议，劳动者可以依法申请劳动仲裁。

二、申请劳动仲裁的条件

1. 扣钱行为需无正当理由：若公司扣钱是基于合法的规章制度或劳动者自身过错（如严重违反公司规定、造成重大损失等），且该规章制度已经劳动者确认或公示，则可能不属于劳动仲裁直接处理的范畴。但若公司无法提供合理依据，扣钱行为则可能被视为违法。
2. 准备相关证据：尽管工资条上未体现扣钱，但劳动者仍需收集其他证据来证明公司存在扣钱行为。这些证据可以包括：银行工资流水明细（显示实际到账金额与应发金额不符）、与公司沟通扣钱的聊天记录或书面通知、考勤记录（若扣钱与考勤相关）、同事证言等。

三、申请劳动仲裁的流程

1. 提交仲裁申请：向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请。申请书应详细说明申请人与被申请人的基本信息、仲裁请求（如要求公司支付被克扣的工资及赔偿金）、事实与理由（包括公司扣钱的具体情况、证据等），并附上收集的证据材料。
2. 等待受理与通知：仲裁委员会在收到申请后会进行审查，符合受理条件则予以受理，并将仲裁申请书副本送达被申请人（即公司），同时通知双方开庭时间。
3. 开庭审理：双方当事人在指定时间到达仲裁庭参加庭审。在庭审过程中，双方可以进行陈述、举证、质证等环节，就争议焦点进行辩论。劳动者需充分利用这一机会，清晰、准确地陈述自己的诉求和理由，并出示相关证据。
4. 裁决与执行：仲裁庭在审理后作出裁决。若用人单位对裁决结果不履行，劳动者可在规定期限内向法院申请强制执行。一般情况下，仲裁庭会在受理仲裁申请之日起45日内结束审理，案情复杂需要延期的，延长期限不得超过15日。

四、注意事项

1. 仲裁时效：劳动者应在扣钱行为发生之日起一年内提起仲裁，以确保符合《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》规定的仲裁时效。超过时效可能会影响仲裁的申请和受理。
2. 积极配合仲裁庭：在整个仲裁流程中，劳动者应积极配合仲裁庭的工作，提供必要的证据和材料，并按时参加庭审等活动。这有助于仲裁庭更全面地了解案情，作出公正裁决。

五、可能面临的法律后果

若仲裁庭认定公司存在无故扣钱的行为，将依法裁决公司支付被克扣的工资，并可能要求公司支付相应的经济补偿或赔偿金。这有助于维护劳动者的合法权益，同时也对公司形成了法律约束，促使其规范用工行为。

综上所述，当公司扣钱且工资条上未体现时，若该扣钱行为无正当理由，劳动者完全有权依法申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在申请过程中，劳动者需确保扣钱行为是无正当理由的，并准备好相关证据材料。同时，也应注意仲裁时效和积极配合仲裁庭的工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。