上班打瞌睡扣工资是否违法，需分情况讨论：
若公司规章制度明确规定上班打瞌睡属于违纪行为，并明确相应的扣工资处罚措施，且该规章制度经过民主程序制定、已公示或告知劳动者，同时不违反法律、行政法规及政策规定，也不存在明显不合理的情形，那么公司依据此规章制度对上班打瞌睡的员工扣工资，一般不违法。
- 法律依据：根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第五十条，用人单位通过民主程序制定的规章制度，不违反国家法律、行政法规及政策规定，并已向劳动者公示的，可以作为人民法院审理劳动争议案件的依据。
- 实际操作：公司应确保规章制度的合法性、合理性，并明确告知员工，以便在员工出现违纪行为时，能够依据规章制度进行合理处罚。
若公司规章制度未明确规定上班打瞌睡属于违纪行为，或未明确扣工资的处罚措施，或者规章制度未经民主程序制定、未公示或告知劳动者，或者规章制度违反法律、行政法规及政策规定，或者存在明显不合理的情形，那么公司因员工上班打瞌睡而扣工资，可能违法。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
- 实际操作：若公司规章制度存在上述问题，员工有权拒绝公司的扣工资处罚，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
额外建议：
- 对于公司：应制定合法、合理、明确的规章制度，并确保经过民主程序制定、已公示或告知劳动者。在处罚员工时，应依据规章制度进行，避免随意扣工资等违法行为。
- 对于员工：应了解公司的规章制度，遵守劳动纪律，避免出现违纪行为。若因特殊原因（如身体不适、工作疲劳等）导致上班打瞌睡，应及时向公司说明情况，寻求理解或调整工作安排。若公司因此扣工资，且规章制度存在违法或不合理情形，员工有权维护自己的合法权益。
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