在“上一休一”的工作制度下，加班费的计算确实是一个需要细致考虑的问题，它涉及到工作时间、工资基数以及加班性质等多个方面。以下是对这一问题的详细解答：
一、核心原则
首先，要明确的是，“上一休一”并不意味着工作时间一定少于标准工时。因此，在计算加班费时，关键是要确定员工在特定周期内的实际工作时间是否超出了法定标准。如果超出了，那么超出部分就应被视为加班，并据此来计算加班费。
二、工作时间与加班时间的界定
标准工时制：在标准工时制下，每日工作时间不应超过8小时，每周工作时间不应超过40小时。在“上一休一”的模式下，如果单个班次的时间超过了8小时，或者周累计工作时间超过了40小时，那么超出部分就应被视为加班时间。
特殊工时制：如果采用的是不定时工作制或综合计算工时工作制，这两种制度需要经过劳动行政部门的审批。在不定时工作制下，通常没有加班工资，但在法定节假日工作需要按照300%的标准支付工资。综合计算工时工作制则允许在计算周期内灵活安排工作时间，但总工作时间不得超过法定标准，超出部分同样视为加班。
三、工资基数的确定
加班费的计算基数一般依据劳动合同的约定，且这个基数不得低于当地的最低工资标准。如果劳动合同中没有明确约定，那么通常可以按照正常出勤月工资的70%来确定，这个数值同样不得低于最低工资标准。
四、加班费的计算方法
平时加班：如果是在工作日延长工作时间，那么加班费应按照不低于本人小时工资标准的150%来计算。
休息日加班：如果是在周末或法定节假日之外的其他休息日工作，且不能安排补休，那么加班费应按照不低于本人日或小时工资标准的200%来支付。
法定节假日加班：在法定节假日加班的情况下，加班费应按照不低于本人日或小时工资标准的300%来支付。例如，如果某员工的日工资是300元，那么在法定节假日加班一天，他应得的加班费就是900元。
五、实际操作中的注意事项
准确记录：用人单位应准确记录员工的出勤情况和工作时长，特别是加班的具体时间和日期，以便准确计算加班费。
合法合规：在计算加班费时，应确保遵循相关法律法规，避免因误解或操作不当而引发劳动争议。
及时支付：用人单位应按规定及时足额支付加班费，不得克扣或拖欠。
六、特殊情况的处理
如果“上一休一”的工作模式涉及到特殊行业或企业，可能有自己的加班工资计算规定。在这种情况下，应按照相关合同或规章制度来执行。
如果劳动者对加班费的计算有疑问或争议，可以通过与用人单位协商、向劳动保障监察机构投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等法律途径来维护自己的权益。
综上所述，“上一休一”制度下的加班费计算是一个复杂但重要的过程。为了确保计算的准确性和合法性，建议用人单位严格遵循相关法律法规，建立健全的考勤制度和加班费计算机制。同时，劳动者也应了解自己的权益和计算方法，以便在必要时维护自己的合法权益。