对于依法应当检疫而未经检疫、货值达500万的动物，将面临没收违法所得、罚款等行政处罚，情节严重的还可能被追究刑事责任。具体处理方式如下：

1. 行政处罚：

   • 根据《中华人民共和国动物防疫法》的相关规定，依法应当检疫而未经检疫的动物，由动物卫生监督机构责令改正，处同类检疫合格动物货值金额百分之十以上百分之五十以下罚款。对于货值500万的动物，罚款金额将相当可观，具体数额将由动物卫生监督机构根据实际情况裁量。
   • 若该批动物被查获时，已经部分销售或处理，那么违法所得部分也将被没收。

2. 补检与处理：

   • 对于未经检疫的动物，动物卫生监督机构有权要求货主进行补检。如果补检合格，那么该批动物可以依法进入市场流通；但如果补检不合格，那么该批动物将被按照相关规定进行无害化处理，如焚烧、深埋等，以防止疫情扩散。

3. 刑事责任：

   • 如果未经检疫的动物携带了重大动物疫病，且该疫病对公共卫生安全造成了严重威胁，或者货主在明知动物未经检疫的情况下仍然进行销售，导致疫情扩散，那么货主还可能面临刑事责任的追究。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，这可能构成妨害动植物防疫、检疫罪等罪名。

建议：

• 对于货主而言，应严格遵守动物防疫法律法规，确保所有动物都经过合法检疫后再进行销售或处理。
• 如果发现未经检疫的动物，应立即向当地动物卫生监督机构报告，并配合其进行调查和处理。
• 在日常经营中，应建立健全的动物防疫管理制度，加强员工培训，提高防疫意识，以避免类似违法行为的发生。

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