核心结论：提成制下加班费高于销售提成本身不违法，但需确保加班费计算基数和提成规则符合法律规定；若企业通过调整提成规则规避加班费支付义务，则可能涉嫌违法。以下从法律合规性和企业操作合理性两个角度展开分析：

1. 法律层面：加班费与销售提成的性质差异

根据《劳动法》及《工资支付暂行规定》，加班费是法定补偿，计算基数通常为劳动者正常工作时间工资（不含提成、奖金等浮动收入），且加班时长和倍数有明确限制（如工作日1.5倍、休息日2倍、法定节假日3倍）。而销售提成属于激励性收入，其计算方式（如销售额比例、利润分成等）由企业与劳动者约定，法律未强制要求其与加班费挂钩。

关键点：

• 若企业依法计算加班费（如以基本工资为基数），且销售提成规则合法（如无歧视性条款），则加班费高于提成不构成违法。
  
• 若企业试图通过“将提成计入加班费基数”或“以提成替代加班费”等方式规避法定义务，则可能违反《劳动法》第44条关于加班费支付的规定。

2. 企业操作层面：需平衡激励与合规

若企业发现提成制下加班费高于销售提成，可能反映提成规则设计不合理（如提成比例过低、考核周期过长），或加班管理存在漏洞（如强制加班、未记录实际工时）。此时需调整：

建议方向：

• 优化提成规则：例如提高提成比例、缩短考核周期（如按周/月结算），使提成收入与劳动投入更匹配。
  
• 规范加班管理：明确加班审批流程，避免无效加班；若需加班，可依法支付加班费或安排调休，而非依赖提成补偿。
  
• 透明化薪酬结构：在劳动合同或规章制度中明确加班费计算基数、提成规则及两者关系，减少争议。

3. 劳动者应对：如何维护权益

若劳动者认为企业存在以下情形，可依法维权：

• 未足额支付加班费：以基本工资为基数计算加班费，但实际应包含部分固定补贴（需根据地方规定判断）。
  
• 以提成替代加班费：如企业声称“提成已包含加班补偿”，但无法证明提成与加班时长直接相关。
  
• 强制加班且不支付费用：违反《劳动法》第41条关于加班时长的限制。

维权途径：

• 收集证据（如考勤记录、工资条、提成协议、加班通知等）；
  
• 向企业协商要求补足差额；
  
• 向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结：提成制下加班费高于销售提成本身不违法，但需确保两者计算规则符合法律要求。企业应通过优化薪酬设计平衡激励与合规，劳动者则需关注自身权益是否被侵害。如有具体案例或细节需要进一步分析，可直接向我咨询。