针对您提出的“发现有职业禁忌症员工已经离职了怎么处理”的问题，这主要涉及到员工离职后职业病或职业禁忌症的认定与待遇问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，职业禁忌症与职业病在法律上有一定的区别，但两者都涉及到员工在职业活动中可能受到的健康损害。若员工在离职后被诊断出与职业活动相关的健康问题，特别是职业病，其处理方式需依据相关法律法规进行。
根据《人力资源社会保障部关于执行〈工伤保险条例〉若干问题的意见》(人社部发〔2013〕34号)的相关规定，对于曾经从事接触职业病危害作业、当时未发现罹患职业病、离职后被诊断或鉴定为职业病的员工，若符合以下条件，可以自诊断、鉴定为职业病之日起一年内申请工伤认定：
对于您提到的职业禁忌症员工已离职的情况，若该员工在离职后被诊断出与职业活动直接相关的健康问题（且该问题在离职时未被发现，但符合职业病的定义或相关标准），且该员工属于上述两类人员之一，那么该员工有权在一年内申请工伤认定。
处理步骤建议如下：
确认诊断结果：首先，需要确认员工的诊断结果是否确实与职业活动相关，且符合职业病的定义或相关标准。
了解员工情况：了解员工离职的具体原因、离职时间以及离职后是否再从事接触职业病危害作业等情况，以判断其是否符合申请工伤认定的条件。
协助申请工伤认定：若员工符合申请条件，且希望申请工伤认定，您可以协助员工准备相关材料，如职业病诊断证明书、劳动合同、离职证明等，并指导其向当地社会保险行政部门提交申请。
关注后续处理：一旦工伤认定申请被受理，社会保险行政部门将进行工伤认定和劳动能力鉴定。根据认定结果和鉴定等级，员工将有权享受相应的工伤保险待遇。若用人单位在员工从业期间依法为其缴纳了工伤保险费，则待遇将由工伤保险基金和用人单位共同支付；若未依法缴纳，则由用人单位按照相关规定支付待遇。
加强预防与管理：为了避免类似情况的再次发生，建议您加强职业健康管理，定期对员工进行职业健康检查，及时发现并处理职业禁忌症和职业病问题。同时，加强员工职业健康培训，提高员工的职业健康意识和自我保护能力。
希望以上解答能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时与我联系。