有职业禁忌的员工可以协商解除劳动合同。但具体处理需根据法律法规和实际情况来判断，以下是对此问题的详细分析：

1. 职业禁忌症的定义与影响：

   • 职业禁忌症是指劳动者在从事特定职业或接触特定职业病危害因素时，因个人特殊生理或病理状态而更易于遭受职业病危害、罹患职业病，或导致原有疾病加重，甚至可能诱发对他人生命健康构成危险的疾病。
   • 劳动者被诊断出职业禁忌症后，其工作能力可能受到影响，无法继续从事原工作或接触原职业病危害因素。

2. 协商解除劳动合同的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动者与用人单位可以协商一致解除劳动合同。
   • 在协商过程中，双方应就解除劳动合同的条件、经济补偿等事项进行充分沟通和协商。

3. 协商解除劳动合同的具体情形：

   • 若劳动者因职业禁忌症不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作，双方可以协商解除劳动合同。
   • 在协商解除时，用人单位应根据劳动者的工作年限和实际情况，依法支付经济补偿。

4. 注意事项：

   • 协商解除劳动合同应确保双方意思表示真实、合法，不得存在欺诈、胁迫等违法情形。
   • 用人单位在协商解除过程中，应充分保障劳动者的合法权益，不得随意降低经济补偿标准或侵害劳动者的其他权益。

5. 法律建议：

   • 对于有职业禁忌症的劳动者，建议其在与用人单位协商解除劳动合同时，充分了解自己的权益和法律规定，确保协商结果合法、有效。
   • 如在协商过程中遇到争议或问题，可以及时向当地劳动监察部门咨询或寻求专业律师的帮助。

综上所述，有职业禁忌的员工可以与用人单位协商解除劳动合同，但具体处理需根据法律法规和实际情况来判断。在协商过程中，双方应充分沟通、协商，并确保协商结果合法、有效。