结论前置：有劳动合同但未交社保的情况下，能否以员工身份为公司代理案件，需分情况讨论，具体如下：

1. 从员工身份与代理权限的角度
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，员工能否代理公司参与诉讼，核心在于其是否具备“公司工作人员”身份及公司明确授权。

   • 若劳动合同真实有效，且公司出具授权委托书（需法定代表人签字并加盖公章），明确授权该员工代理案件（如提交材料、参与庭审等），则员工可以公司代理人身份参与诉讼。
     
   • 未交社保本身不影响劳动合同的效力（社保缴纳问题属行政处罚范畴，与劳动关系存续无关），因此员工身份的合法性不受影响。
     

2. 从社保未缴纳的潜在风险角度
   虽然社保未缴纳不影响代理资格，但需注意：

   • 若公司因未缴社保被员工起诉（如劳动仲裁或诉讼），该员工作为代理人可能面临“利益冲突”质疑。例如，若员工同时主张公司未缴社保的赔偿，再代理公司参与其他案件，可能被对方认为代理行为损害公司利益或存在偏袒。
     
   • 司法实践中，法院可能要求代理人签署《无利益冲突声明》，若员工自身与公司存在社保纠纷，需提前披露并评估是否影响代理权限。
     

3. 从代理效果与实务建议角度

   • 若案件与公司核心利益相关（如重大合同纠纷、知识产权案件），建议公司委托专业律师代理，以降低诉讼风险。员工代理虽可行，但可能因法律知识不足影响案件结果。
     
   • 若公司坚持由员工代理，需确保：
     
     • 劳动合同无争议（如已签书面合同、工资发放记录完整）；
       
     • 授权委托书内容明确（代理权限范围、期限等）；
       
     • 员工无其他可能影响代理公正性的情形（如与公司高管存在亲属关系、自身涉及与公司相关的其他诉讼等）。
       

总结：未交社保不影响员工以公司名义代理案件的资格，但需满足劳动合同有效、公司明确授权、无利益冲突等条件。若涉及复杂案件或存在潜在风险，建议优先委托专业律师处理。如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。