结论：协商好了是否可以撤案，需根据案件类型和所处阶段来判断，不同情况下处理方式不同。以下分情况详细说明：
一、刑事案件
自诉案件：
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百一十二条，自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。
- 分析：在自诉案件中，如果双方协商好了，自诉人是有权撤回自诉的，即撤案。这通常适用于情节轻微、双方矛盾不大的案件，如侮辱、诽谤等轻微刑事案件。
公诉案件：
- 法律依据：公诉案件由检察机关代表国家提起诉讼，撤案决定权在检察机关。
- 分析：在公诉案件中，即使双方协商好了，也不能直接撤案。但协商结果可能影响量刑或作为从轻、减轻处罚的情节。例如，在故意伤害案中，双方达成和解，被害人出具谅解书，法院在量刑时会考虑这一情节。
二、民事案件
协商撤诉：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十八条，宣判前，原告申请撤诉的，是否准许，由人民法院裁定。
- 分析：在民事案件中，如果双方协商好了，原告可以向法院申请撤诉。法院会根据案件情况，如是否损害国家、集体或第三人利益等，决定是否准许撤诉。
调解结案：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第九十七条，调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。
- 分析：双方协商好后，也可以选择在法院主持下进行调解，并达成调解协议。调解书签收后，案件即以调解方式结案，无需再行撤诉。
三、行政案件
- 协商撤诉或调解：
- 法律依据：根据《中华人民共和国行政诉讼法》第六十条，人民法院审理行政案件，不适用调解。但是，行政赔偿、补偿以及行政机关行使法律、法规规定的自由裁量权的案件可以调解。
- 分析：在行政案件中，一般不适用调解，但行政赔偿、补偿等案件可以调解。如果双方协商好了，且案件属于可调解范围，可以在法院主持下进行调解并达成调解协议。对于不可调解的行政案件，如果原告申请撤诉且不损害国家、集体或第三人利益，法院可能准许撤诉。
建议：
- 如果您面临的是刑事案件，特别是公诉案件，建议及时与检察机关沟通，了解案件进展和可能的处理方式。
- 如果是民事或行政案件，且双方已经协商好，建议尽快向法院提交撤诉申请或调解协议，以便及时结案。
- 在任何情况下，都建议咨询专业律师，以确保您的权益得到充分保障。
后续行动：如果您有具体的案件情况或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。