公司赔偿时只留几个人又不愿意留其他员工，这一行为是否合法，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：

1. 劳动合同与法定解除条件：

   • 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者解除劳动合同需符合法定条件，如劳动者严重违反用人单位规章制度、不能胜任工作等。若公司仅因赔偿事宜而单方面决定留用部分员工、解雇其他员工，且未遵循法定解除程序，则可能构成违法解除劳动合同。
   • 若公司未按照法定程序解除劳动合同，员工有权要求继续履行合同或获得违法解除的赔偿金。赔偿金通常按照经济补偿标准的二倍来计算，经济补偿标准则根据劳动者在本单位工作的年限和月工资来确定。

2. 经济补偿与赔偿：

   • 在公司进行赔偿或裁员时，应依法向被解雇的员工支付经济补偿。经济补偿的支付标准和条件在《劳动合同法》中有明确规定。
   • 若公司未依法支付经济补偿，员工有权通过劳动仲裁或诉讼途径要求公司支付。此外，如果公司解雇员工的行为被认定为违法，员工还有权要求公司支付违法解除的赔偿金。

3. 平等对待与歧视问题：

   • 公司在处理赔偿和裁员事宜时，应平等对待所有员工，不得因性别、年龄、种族、宗教信仰等因素进行歧视。
   • 若公司存在歧视性解雇行为，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司承担相应的法律责任。

4. 公司决策的合理性与程序正当性：

   • 公司在做出留用或解雇决策时，应确保决策的合理性和程序正当性。这包括进行充分的评估、与员工进行沟通、遵循内部决策程序等。
   • 若公司决策过程存在瑕疵或不合理之处，可能影响其合法性。例如，如果公司未与员工进行充分沟通就单方面做出解雇决定，可能引发劳动争议。

针对您的情况，我建议您采取以下措施：

• 首先，与公司进行沟通，了解公司做出留用或解雇决策的具体原因和依据。
• 如果您认为公司的决策存在违法或不合理之处，可以收集相关证据（如劳动合同、工资单、解雇通知等），并向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
• 在处理过程中，保持冷静和理性，遵循法律程序，以维护自己的合法权益。

若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。