结论前置：员工值班时，上级部门使用视频电话进行抽查，这一行为本身并不直接违反法律规定，但其合法性及合理性需结合具体情境来判断。以下从多个角度进行分析：

1. 从劳动法角度：

   • 合法性：劳动法并未明确禁止用人单位在员工值班时进行抽查，包括视频电话抽查。用人单位有权对员工的工作情况进行监督和管理，以确保工作的正常进行和公司的利益不受损害。因此，从这一角度看，视频电话抽查行为本身并不违法。
   • 合理性：然而，抽查的方式和频率应当合理，不得过度干扰员工的正常工作和生活。如果抽查过于频繁或方式不当，可能会对员工造成不必要的压力和困扰，甚至可能构成对员工隐私权的侵犯（尽管在值班期间，员工的部分隐私权可能受到一定限制）。

2. 从隐私权角度：

   • 值班期间的隐私权：员工在值班期间，虽然处于工作状态，但仍享有一定的隐私权。用人单位在抽查时，应当尊重员工的隐私，不得无故窥探或泄露员工的私人信息。
   • 视频电话抽查的界限：视频电话抽查应当限于与工作相关的内容，如员工是否在岗、工作状态如何等。如果抽查过程中涉及员工的私人生活或无关工作的信息，则可能构成对员工隐私权的侵犯。

3. 从公司规章制度角度：

   • 规章制度的制定：用人单位可以制定规章制度来规范员工的行为和公司的管理。如果公司规章制度中明确规定了值班期间的抽查方式和频率，且这些规定不违反法律法规和公序良俗，那么员工应当遵守。
   • 规章制度的执行：在执行规章制度时，用人单位应当确保公平、公正、公开，不得滥用权力或歧视员工。如果员工对抽查行为有异议，可以通过合法途径进行申诉或投诉。

4. 建议与措施：

   • 对于用人单位：建议用人单位在制定和执行抽查制度时，充分考虑员工的感受和权益，确保抽查行为的合法性和合理性。同时，应当加强与员工的沟通和交流，及时解答员工的疑问和困惑。
   • 对于员工：如果员工认为抽查行为侵犯了自己的合法权益，可以先与用人单位进行协商解决。如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。

总结：员工值班时上级部门使用视频电话进行抽查，这一行为本身并不直接违法，但需结合具体情境来判断其合法性和合理性。用人单位在抽查时应当尊重员工的隐私和权益，确保抽查行为的合法性和合理性；员工在认为自己的权益受到侵犯时，可以通过合法途径进行维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。