结论前置：基本工资低于最低工资标准，但加上补贴后高于最低工资标准，这种情况是否合法需分情况讨论，一般情况下，用人单位支付给劳动者的实际工资（包含基本工资及各项津贴、补贴等）不得低于当地最低工资标准，否则将构成违法。以下是对此问题的详细分析：
一、最低工资标准的定义与内涵
最低工资标准是指劳动者在法定工作时间或依法签订的劳动合同约定的工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位依法应支付的最低劳动报酬。这一标准不仅适用于基本工资，而是涵盖劳动者的全部收入，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等各项收入。但需注意，最低工资标准一般不包含特殊工作环境条件下的津贴、福利待遇以及非经常性、非普遍性的奖励等。
二、法律法规依据
- 《中华人民共和国劳动法》第四十八条明确规定：“国家实行最低工资保障制度。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。”这是国家法律对最低工资制度的直接规定，具有强制性。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条也指出：“如果用人单位支付的劳动报酬低于当地最低工资标准，劳动行政部门将责令其限期支付差额部分，逾期不支付则需按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。”这为劳动者提供了明确的法律救济途径。
三、基本工资低于最低工资标准，加上补贴后高于最低工资标准的合法性分析
- 若补贴属于常规性、普遍性的收入：如岗位津贴、交通补贴、餐补等，这些补贴应计入劳动者的实际工资收入中。在这种情况下，如果基本工资低于最低工资标准，但加上这些补贴后高于最低工资标准，用人单位的行为仍然构成违法。因为最低工资标准考量的是劳动者的全部收入，用人单位必须确保劳动者的实际工资收入不低于当地最低工资标准。
- 若补贴属于特殊工作环境条件下的津贴或非经常性、非普遍性的奖励：如高温津贴、夜班津贴、年终奖等，这些补贴可能不计入最低工资标准的考量范围内（具体需根据当地规定判断）。但即便如此，用人单位也应确保劳动者的基本工资加上常规性、普遍性的补贴后不低于最低工资标准。如果基本工资本身就低于最低工资标准，且加上所有补贴后也仅是勉强高于最低工资标准，这种工资结构可能存在不合理性，且容易引发劳动纠纷。
四、劳动者的权益保护与建议
对于劳动者而言，如果发现自己的基本工资低于当地的最低工资标准，即使加上补贴后高于最低工资标准，也有权要求用人单位调整工资结构，确保基本工资加上常规性、普遍性的补贴后不低于最低工资标准。如果用人单位拒不调整，劳动者可以通过以下途径来维护自己的合法权益：
- 向劳动监察部门投诉：由劳动监察部门责令单位限期支付差额部分，并可能加付赔偿金。
- 申请劳动仲裁：如协商或投诉无果，劳动者可以向劳动仲裁机构提起仲裁申请，要求用人单位补足工资差额并依法支付相应赔偿。
- 提起诉讼：在必要时，劳动者还可以选择通过诉讼途径来进一步维护自己的权益。
总结来说，基本工资低于最低工资标准，加上补贴后高于最低工资标准是否合法，需根据补贴的性质和当地的具体规定来判断。但无论如何，用人单位都应确保劳动者的实际工资收入不低于当地最低工资标准，以维护劳动者的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。