关于您提出的“因为未参加公司会议而被罚款是否合法”的问题，这实际上取决于多个因素，包括罚款主体的性质、罚款的依据以及罚款的程序。下面我将从这几个方面为您详细分析。
首先，从一般法律角度来看，罚款是行政处罚的一种。根据《中华人民共和国行政处罚法》，只有法律、法规明确授权的特定主体（如行政机关）才能实施罚款处罚。普通组织或个人，包括公司、企业等，并没有权力擅自设定罚款条款来约束员工行为。这意味着，如果公司不是行政机关，它就没有直接的罚款权力。
接下来，我们分析不同情境下的具体合法性：
单位内部管理：
- 合法情形：如果公司依据依法制定的规章制度，在合理范围内对员工不参加与工作密切相关的重要会议等行为设定经济处罚措施，并且该规章制度经过了民主程序制定、内容不违反法律法规的强制性规定，并已向员工公示，那么这种处罚可能被视为合理且在一定程度上被认可。但需要注意的是，这种处罚并非基于罚款权力的直接赋予，而是在合理范围内的管理手段。
- 不合法情形：如果公司的罚款规定过于苛刻、不合理，或没有经过合法的制定程序，或罚款金额过高，那么这种罚款是不合法的。
社会组织活动：
- 对于具有行业自律性质的社会组织，如果其会员自愿加入并同意遵守组织章程，且章程中明确规定了会员应当参加特定的会议等活动，并对不参加的行为设定了相应的经济惩戒措施（在不违反法律法规的前提下），那么会员应遵守。但超出权限范围或违反法律法规的罚款规定则是不合法的。
行政机关等公权力机关组织的会议：
- 行政机关等公权力机关在依法履行职责过程中，可以要求相关人员参加会议，并对无故不参加且情节严重的行为，依据相关法律法规进行处罚。但如果没有明确法律依据或处罚程序不合法，那么对不参加会议的人员进行罚款就是违法的。
最后，关于合法处理方式与员工权利：
- 合法处理方式：公司可以依据公司规章制度处理（如警告、记过、降级、解除劳动合同等），依据劳动合同约定处理（如约定违约责任），给予警告与通报批评，或将无故缺席会议纳入绩效考核体系。
- 员工权利：员工对于公司给予的处理享有陈述权、申辩权，并有权依法申请劳动仲裁或提起诉讼。如果公司坚持对员工进行不合理罚款，员工可以向劳动监察部门投诉或通过法律途径解决争议。
综上所述，不参加会议被罚款的合法性需根据具体情况判断。公司应通过合法合规的方式管理员工，并尊重员工的合法权益。如果您认为公司的罚款行为不合法或不合理，建议您及时与公司沟通或寻求法律援助。