单位自然解体时，赔偿的计算基数通常是按应发工资来确定的，而非实发工资。以下是对这一问题的详细解释：

一、应发工资与实发工资的区别

1. 应发工资：指的是劳动者在正常劳动情况下，用人单位应当支付给劳动者的全部工资报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等所有组成部分。它反映了劳动者实际应得的劳动报酬总额。

2. 实发工资：则是劳动者实际收到的工资数额，它可能因各种原因（如社保、公积金、个人所得税等代扣代缴项目）而少于应发工资。

二、单位自然解体时赔偿的计算依据

在单位自然解体（如企业破产、解散等）的情况下，劳动者有权获得相应的经济补偿。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，经济补偿的计算基数通常是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。这里的“平均工资”指的是应发工资的平均值，而非实发工资。

三、具体计算方式

1. 计算周期：通常以劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的工资总额为计算基础。

2. 计算方式：将这十二个月的应发工资总额相加，然后除以十二，得到平均工资。这个平均工资就是计算经济补偿的基数。

3. 经济补偿标准：根据劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

四、特殊情况说明

• 如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。这里的“月工资”同样指的是应发工资。

• 在计算经济补偿时，如果劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月内存在加班、奖金、津贴等额外收入，这些收入也应计入应发工资总额中。

五、建议与注意事项

• 劳动者在面临单位自然解体时，应仔细核对自己的工资记录，确保应发工资的计算准确无误。
• 如果对经济补偿的计算有疑问或争议，可以与用人单位进行协商，或者向劳动争议调解委员会申请调解，必要时还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

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