员工上班去厕所、喝水被扣钱，这种做法是违法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律角度
根据《中华人民共和国劳动法》以及相关劳动法规的规定，劳动者享有获得劳动报酬的权利，且用人单位不得无故克扣劳动者的工资。员工在工作期间去厕所、喝水是基本的生理需求，属于合理的休息和必要活动，这些时间应当被计入工作时间，用人单位无权因此扣减工资。
具体来说，如果用人单位以员工去厕所、喝水为由扣减工资，这实际上构成了对劳动者劳动报酬权的侵犯。劳动者有权要求用人单位补发被扣减的工资，并可以依据相关法律法规向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
二、实际操作角度
在实际操作中，用人单位应当尊重员工的合理需求，为员工提供必要的休息和饮水条件。如果员工因为去厕所、喝水等合理活动而受到不公正的待遇，如扣减工资，这不仅会损害员工的利益，也会影响员工的工作积极性和工作效率，进而对用人单位的整体运营产生负面影响。
三、建议与措施
与用人单位沟通：如果员工发现自己的工资被无故扣减，首先可以尝试与用人单位进行沟通，了解扣减工资的具体原因，并要求用人单位补发被扣减的工资。
向劳动监察部门投诉：如果与用人单位沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理。
申请劳动仲裁：如果劳动监察部门无法解决问题，员工还可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结来说，员工上班去厕所、喝水被扣钱是违法的。用人单位应当尊重员工的合理需求，不得无故克扣员工的工资。如果员工遇到此类问题，应当积极采取措施维护自己的合法权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。