可以申请停工留薪期工资，但能否成功获得需视具体情况而定。以下从不同角度为你详细分析：
停工留薪期工资的基本概念
停工留薪期是指职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的期间。在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这是法律赋予工伤职工的一项重要权益，旨在保障工伤职工在接受治疗期间的基本生活和经济来源。
公司仅发50元工资的合法性分析
若公司行为违法：
- 根据《工伤保险条例》第三十三条：“职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。”如果公司仅发放50元工资，远低于你原本的工资水平，那么公司的行为显然违反了这一规定。
- 在这种情况下，你有权向公司提出异议，要求公司按照你原本的工资水平支付停工留薪期工资。如果公司拒绝支付，你可以通过劳动争议仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的权益。
若存在特殊情况：
- 虽然公司仅发放50元工资看起来不合理，但也可能存在一些特殊情况。例如，公司可能认为你的停工留薪期已经结束，或者认为你的工伤情况并不严重，因此只发放了部分工资。然而，这些情况都需要有充分的证据和合理的解释来支持。
- 如果公司能够提供充分的证据证明其行为的合理性，那么你可能需要接受这一结果，或者通过进一步的法律程序来寻求解决方案。但通常情况下，这种特殊情况较为少见，且公司需要承担较高的举证责任。
申请停工留薪期工资的建议
收集证据：
- 在申请停工留薪期工资之前，你需要收集相关的证据来证明你的工伤情况、停工留薪期的时长以及你原本的工资水平。这些证据可以包括工伤认定书、医疗证明、工资单等。
与公司协商：
- 在收集到足够的证据后，你可以先尝试与公司进行协商，要求公司按照你原本的工资水平支付停工留薪期工资。如果公司同意协商并达成一致意见，那么问题就可以得到妥善解决。
申请劳动争议仲裁或诉讼：
- 如果公司拒绝协商或者协商无果，你可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，你需要提交相关的证据来支持你的主张，并接受仲裁机构或法院的裁决。
可能的法律后果
- 如果公司被认定存在违法行为，那么除了需要支付你停工留薪期工资外，还可能面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。
- 如果你通过法律途径成功维护了自己的权益，那么你还可以要求公司承担因仲裁或诉讼而产生的相关费用，如律师费、仲裁费等（具体能否要求承担需视当地法律法规及案件具体情况而定）。
总结与建议：公司仅发放50元工资显然是不合理的，你有权申请停工留薪期工资。在申请过程中，你需要收集相关证据、与公司协商，并在必要时通过法律途径来维护自己的权益。如果你在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。