在职员工申请确认劳动关系仲裁是会受理的。具体分析如下：

一. 确认劳动关系仲裁的受理

1. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条，中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法，其中包括“（一）因确认劳动关系发生的争议”。这表明，确认劳动关系是劳动争议的一种，属于仲裁的受理范围。

2. 受理条件：对于在职员工提出的确认劳动关系仲裁申请，只要其提供了基本的证据材料，如工作证、工资支付记录、考勤记录等，证明与用人单位存在劳动关系争议，仲裁委员会就应当受理。

• 例如，某员工在一家公司工作多年，但公司一直未与其签订劳动合同。员工为了维护自己的权益，可以向仲裁委员会提出确认劳动关系的仲裁申请，仲裁委员会应当受理。

二. 确认劳动关系的重要性

确认劳动关系对于劳动者来说至关重要，它关系到劳动者的工资、福利、社会保险等各项权益。在劳动关系不明确或存在争议的情况下，通过仲裁确认劳动关系，可以为劳动者提供法律保障，确保其合法权益得到维护。

我建议：如果您与用人单位之间存在劳动关系争议，可以积极向当地的劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请，并准备充分的证据材料以支持您的主张。如有进一步需要，您可以继续咨询我。