公司代发工资三个月自动解除的做法并不合法。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、劳动合同与工资支付的法律基础
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者建立劳动关系后，应当签订书面劳动合同，并按照劳动合同的约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。工资支付是劳动合同的重要组成部分，用人单位不得随意变更或解除。
二、代发工资与自动解除的合法性分析
代发工资的合法性：
- 代发工资本身并不违法，只要用人单位与代发机构之间有合法的协议，且代发行为符合相关法律法规的规定，如按时足额支付工资、提供工资清单等。
自动解除的合法性：
- “三个月自动解除”这一做法缺乏法律依据。劳动合同的解除应当遵循法定程序和条件，如双方协商一致、劳动者严重违反用人单位规章制度、用人单位经济性裁员等。
- 除非劳动合同或相关法律法规中明确规定了代发工资三个月后自动解除的条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，否则这种做法是不合法的。
三、可能的法律后果
劳动者权益受损：
- 如果公司因代发工资三个月而自动解除与劳动者的劳动关系，且未按照法定程序支付经济补偿等，劳动者的合法权益将受到损害。
用人单位承担法律责任：
- 用人单位可能因违法解除劳动合同而面临支付赔偿金、继续履行劳动合同等法律责任。同时，还可能受到劳动行政部门的处罚。
四、建议与措施
审查劳动合同：
- 劳动者应仔细审查与用人单位签订的劳动合同，了解其中关于工资支付和劳动合同解除的条款。
与用人单位协商：
- 如果对代发工资或劳动合同解除有疑问或不满，劳动者应与用人单位进行协商，寻求解决方案。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，劳动者可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权益和可行的维权途径。
向劳动行政部门投诉：
- 如果用人单位存在违法行为，劳动者可以向当地劳动行政部门投诉，要求其依法处理。
总结：公司代发工资三个月自动解除的做法并不合法。用人单位应当遵守相关法律法规，按照劳动合同的约定和国家规定向劳动者支付劳动报酬，并遵循法定程序和条件解除劳动合同。如有任何疑问或不满，劳动者应及时与用人单位协商或寻求法律援助。如果你还有其他关于劳动工伤方面的法律问题，可以直接向我咨询。