离职后公司三个月发工资是违法的。下面我将从不同角度为您详细分析：
一、法律规定角度
根据《工资支付暂行规定》第九条以及《工资支付条例》第十三条等相关法律法规，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这意味着，离职时用人单位应当立即结清工资，而不是拖延至三个月后。
二、合同约定角度
如果劳动合同中有明确约定：
- 即便合同中有规定离职后三个月发放工资，且该约定看似是双方协商一致的结果，但这种约定如果违反了法律法规的强制性规定（如上述提到的工资支付规定），那么该约定仍然是无效的。
- 即便约定有效，用人单位也应按照约定时间准确发放工资。若逾期，仍属拖欠工资行为，劳动者有权要求用人单位及时支付。
如果劳动合同未作约定：
- 通常情况下，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次性付清劳动者工资。离职三个月后才发工资，明显不合理且违法。
三、劳动者维权角度
面对公司拖欠工资的情况，劳动者可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
与用人单位协商：
- 劳动者可以首先尝试与用人单位进行协商，要求其及时支付工资。这是最为直接和简便的方式。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权责令用人单位限期支付工资，并对用人单位的违法行为进行处罚。
向劳动争议仲裁委员会申请仲裁：
- 劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付工资及相应赔偿。仲裁程序相对正式，但一般能够最终解决问题。如果仲裁结果不满意，劳动者还可以向法院提起诉讼。
四、法律后果角度
如果用人单位拖欠工资，除了需要支付拖欠的工资外，还可能面临以下法律后果：
支付经济补偿金：
- 如果劳动者是以拖欠工资为由提出的解除劳动关系，那么用人单位还需要支付经济补偿金。
支付双倍工资：
- 如果用人单位未与劳动者签订劳动合同，劳动者还可以要求支付未签订劳动合同的双倍工资。
行政处罚：
- 劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行处罚，包括罚款等。
总结与建议：
离职后公司三个月发工资是违法的。劳动者在面对这种情况时，应当积极维护自己的合法权益，通过与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁等方式来要求用人单位及时支付工资。如果还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。