结论：工伤员工复工后，将原八小时工作制调为十二小时工作制，一般不合理且可能违法，需结合具体情况判断。
从劳动合同变更角度分析
根据《劳动合同法》第三十五条，变更劳动合同（包括工作时间）需双方协商一致并书面确认。若原合同明确约定八小时工作制，用人单位单方面延长至十二小时，属于违法变更。即使员工因工伤暂时无法从事原岗位，用人单位也需通过协商调整工作内容或工时，而非强制延长。
从工伤员工劳动能力鉴定角度分析
若员工经劳动能力鉴定委员会评定为部分丧失劳动能力，用人单位应根据鉴定结果安排适当工作。根据《工伤保险条例》第三十六条，用人单位不得擅自增加工时或加重劳动强度。十二小时工作制可能超出员工身体承受范围，违反“合理调整岗位”的法定义务。
从工时制度合法性角度分析
根据《劳动法》第三十六条，劳动者每日工作时间不超过八小时，平均每周不超过四十四小时。即使实行综合计算工时制或不定时工时制，也需经劳动行政部门审批，且平均日工作时间不得超过法定标准。未经审批的十二小时工作制，属于违法延长工时。
从特殊保护义务角度分析
工伤员工享有法律特殊保护。根据《企业职工工伤事故分类标准》及地方性法规，用人单位需为工伤员工提供符合其身体状况的工作环境。强制延长工时可能构成对工伤员工权益的侵害，员工有权拒绝并主张赔偿。
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