员工截流货款并要求公司对账的行为是否合法，需分情况讨论：

1. 若截流货款行为本身违法，则要求对账不改变违法性质

• 职务侵占风险：根据《刑法》第二百七十一条，员工利用职务便利将公司财物非法占为己有，数额较大的，构成职务侵占罪。若员工截流货款后拒不归还，或通过虚假对账掩盖侵占行为，可能触犯该罪名。
• 民事违约责任：即使截流金额未达刑事标准，员工仍违反《劳动合同法》第三十九条，公司可依据内部规章制度（如《员工手册》）解除劳动合同，并要求赔偿损失。
• 对账的合法性边界：若员工以“对账”为名拖延归还货款，或伪造对账记录，可能构成诈骗或伪造公司文件，进一步加重违法性。

2. 若截流货款存在合理争议，要求对账可能是合法维权手段

• 工资或提成争议：若员工认为公司拖欠工资、奖金或销售提成，截流货款可能属于“自力救济”。但根据《劳动争议调解仲裁法》第五条，员工应通过劳动仲裁或诉讼解决争议，而非私自截流。
• 对账的必要性：若员工主张货款中包含其应得收入（如代收客户款项中的提成），要求对账是合理诉求。但需注意：
  • 程序合法性：员工应通过正式渠道（如书面申请）要求对账，而非单方面截流。
  • 证据保留：员工需提供劳动合同、提成协议等证据，证明其有权截流部分货款。

3. 公司应对建议

• 立即核查事实：公司应第一时间核对货款流向、员工授权范围及对账记录，区分是恶意侵占还是合理争议。
• 分类处理：
  • 恶意截流：固定证据（如银行流水、聊天记录）后报警或提起民事诉讼，要求返还货款并赔偿损失。
  • 合理争议：启动内部对账流程，必要时委托第三方审计，同时通过劳动仲裁解决工资纠纷。
• 完善制度：修订《财务管理制度》，明确货款收付流程、员工授权范围及违规处罚条款，降低后续风险。

4. 员工注意事项

• 避免私力救济：即使认为公司拖欠报酬，也应通过劳动仲裁、诉讼等合法途径维权，私自截流可能承担刑事责任。
• 对账的合法方式：若需对账，应书面通知公司并留存证据，避免以“截流”方式施压。

总结：员工截流货款的行为本身可能违法，要求对账不能改变其违法性（除非存在合理争议且程序合法）。建议双方通过协商、仲裁或诉讼解决分歧，避免矛盾升级。如有具体案情，可进一步向我咨询。