员工未配合公司劳动能力鉴定是否属于严重违纪，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
1. 员工无正当理由拒不配合
- 法律后果：根据相关规定，若员工处于工伤认定阶段且无正当理由拒绝劳动能力鉴定，应停止享受工伤保险待遇，待其同意鉴定并完成后再重新核发待遇。这表明，无正当理由拒不配合鉴定，直接影响员工自身权益（如停发工伤待遇），但法律未直接将其定性为“严重违纪”。
- 公司处理依据：若公司有合法有效的规章制度，且规章制度中明确将“无正当理由拒不配合劳动能力鉴定”列为严重违纪行为（如警告、记过、解除劳动合同等），公司可依据制度处理。但需注意：
- 制度合法性：规章制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论），并向员工公示或告知，否则可能因程序违法被认定无效。
- 证据留存：公司需留存通知员工鉴定的证据（如书面通知、邮件、短信等），以证明员工“无正当理由拒不配合”。若无法证明，公司可能面临违法解除的风险。
2. 员工有合理理由拒不配合
- 合理理由的情形：若员工因身体原因（如伤情未稳定、需进一步治疗）无法配合鉴定，或公司未履行告知义务（如未通知鉴定时间、地点、流程），导致员工无法配合，则不能认定为严重违纪。
- 公司应对建议：此时公司应与员工协商，了解拒不配合的具体原因，协助解决困难（如调整鉴定时间、提供必要协助），而非直接认定为违纪。
3. 员工故意不配合以获取不当利益
- 法律定性：若公司有证据证明员工故意不配合鉴定（如伪造伤情、拖延时间以获取额外赔偿），可能构成“以欺诈手段获取不当利益”，此时公司可依据规章制度处理，甚至解除劳动合同且无需支付经济补偿。
- 证据要求：公司需提供充分证据（如监控录像、证人证言、医疗记录等），证明员工存在主观故意。若证据不足，公司可能面临败诉风险。
法律建议
公司角度：
- 完善规章制度，明确“拒不配合劳动能力鉴定”的处理规则（如分级处罚、解除条件），并确保制度合法有效。
- 履行告知义务，通过书面、邮件等方式通知员工鉴定时间、地点、流程，并留存证据。
- 员工拒不配合时，先沟通了解原因，再依据制度处理，避免直接认定为严重违纪。
员工角度：
- 了解自身义务，配合劳动能力鉴定是享受工伤保险待遇的前提。
- 若因合理原因无法配合，及时与公司沟通，避免被误认为“无正当理由拒不配合”。
- 若公司违法处理，可申请劳动仲裁维护权益。
总结：员工未配合劳动能力鉴定是否属于严重违纪，需结合拒不配合的原因、公司制度合法性、证据充分性等因素综合判断。若您遇到具体问题，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细法律建议。