在综合计算工时工作制下，延长工作时间的工资支付标准主要依据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，具体支付标准根据加班时间的不同而有所差异。以下是对此问题的详细解析：

一、综合计算工时工作制概述

综合计算工时工作制是针对特定行业或岗位因工作性质特殊而采用的一种工时制度。它允许在一定周期（如周、月、季、年）内灵活安排工作时间，但整个周期内的平均工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。这种制度旨在适应企业连续作业、受季节影响或自然条件限制等特殊情况。

二、延长工作时间的认定与工资支付标准

1. 延长工作时间的界定：

   • 在综合计算周期内，职工实际工作时间超过该周期的法定标准工作时间总数，超出部分即为延长工作时间。

2. 工资支付标准：

   • 工作日延长工作时间：用人单位安排劳动者在正常工作时间以外延长工作时间的，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付加班工资。
   • 法定节假日工作：无论整个周期内的总工作时间是否超过法定标准时间，只要劳动者在法定节假日工作，都应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班工资。

三、具体计算示例

假设某员工月工资为6000元（按21.75天计薪），其小时工资约为34.48元/小时（6000元 ÷ 21.75天 ÷ 8小时）。

1. 工作日延长工作时间：

   • 若某工作日该员工被安排延长工作2小时，则这2小时的加班费至少应为：34.48元/小时 × 150% × 2小时 = 103.44元。

2. 法定节假日工作：

   • 若该员工在法定节假日工作一天（8小时），则他当天应得的加班费为：34.48元/小时 × 300% × 8小时 = 827.52元（或按日工资计算：6000元 ÷ 21.75天 × 300% ≈ 827.59元，由于小时工资计算存在四舍五入，两者结果略有差异，但均符合法定标准）。

四、注意事项

1. 最低工资保障：加班工资基数不得低于当地最低工资标准。
2. 协商优先：劳动合同可约定更高标准，但不得低于法定最低比例。
3. 举证责任：劳动者需证明加班事实，建议保留考勤记录、加班通知等证据。

五、法律后果与维权途径

若用人单位未依法支付加班工资，劳动者可通过以下途径维权：

• 与单位协商；
• 向劳动监察部门投诉；
• 申请劳动仲裁或提起诉讼。

总结：在综合计算工时工作制下，延长工作时间的工资支付标准需严格按照《中华人民共和国劳动法》的规定执行。用人单位应合理安排工作时间，确保劳动者的合法权益得到保障。同时，劳动者也应了解自己的权益，如遇到用人单位未按规定支付加班费的情况，可依法维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。