民办培训机构法人无权直接停职未签劳动合同但违法犯罪的员工，需通过法定程序处理。以下从不同角度进行分析：
一、未签劳动合同与停职的关联性
未签劳动合同的法律后果：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。但这并不意味着用人单位可以随意停职或解雇员工。
停职的合法性：
- 停职通常不是一种独立的法律处分措施，而是用人单位内部管理的一种手段。在未签劳动合同的情况下，用人单位无权直接停职员工，除非员工存在严重违反公司规章制度或法律法规的行为。
二、员工违法犯罪的处理方式
刑事责任：
- 如果员工涉嫌违法犯罪，应由公安机关依法进行调查和处理。在刑事诉讼过程中，员工可能会被采取强制措施，如拘留、逮捕等，但这与用人单位的停职决定无关。
用人单位的处理：
- 在员工涉嫌违法犯罪的情况下，用人单位可以依据内部规章制度或劳动合同中的相关条款，对员工进行纪律处分，如警告、记过、降职、解雇等。但这些处分必须基于合法、合理的依据，并遵循法定程序。
- 如果员工被依法追究刑事责任，用人单位可以依据《劳动合同法》第三十九条的规定解除劳动合同。但在此之前，用人单位不能单方面停职员工。
三、民办培训机构法人的权限与限制
法人权限：
- 民办培训机构法人作为用人单位的代表，有权对员工进行管理和监督。但这种管理权必须受到法律法规和内部规章制度的约束。
限制与义务：
- 法人在行使管理权时，必须尊重员工的合法权益，不得滥用职权或侵犯员工的人身权、财产权等。在未签劳动合同且员工未被依法追究刑事责任的情况下，法人无权直接停职员工。
四、建议与措施
完善劳动合同：
- 民办培训机构应尽快与员工签订书面劳动合同，明确双方的权利和义务，以避免因未签合同而引发的法律纠纷。
依法处理违法犯罪行为：
- 如果员工涉嫌违法犯罪，用人单位应及时向公安机关报案，并配合调查。在刑事诉讼过程中，用人单位应尊重司法程序，不得干扰或阻碍。
遵循法定程序处理员工：
- 在对员工进行纪律处分或解除劳动合同时，用人单位应遵循法定程序，如提前通知、听取员工意见、出具书面决定等。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据你的具体情况，提供专业、全面的法律建议。