合同中同时约定了仲裁和法院诉讼的情况下，通常仲裁协议会被视为无效，因为仲裁和诉讼是两种相互排斥的纠纷解决方式，不能同时选择。以下是对这一问题的详细分析：

一、仲裁协议无效的原因

1. 意思表示不明确：根据《仲裁法》及相关司法解释，仲裁协议应当具有明确的请求仲裁的意思表示、仲裁事项以及选定的仲裁委员会。若合同中既约定仲裁又约定法院诉讼，这种条款属于仲裁协议约定不明，因为当事人对纠纷解决方式的意思表示不明确，无法确定到底是通过仲裁还是诉讼来解决争议。

2. 仲裁协议无法执行：由于仲裁和诉讼是两种相互排斥的纠纷解决方式，同时约定两者会导致争议解决途径不明确，仲裁机构往往不会受理此类案件，因为仲裁协议缺乏明确性和唯一性。

二、处理方式及法律后果

1. 一方申请仲裁，另一方提出异议：

   • 若一方依据合同中的仲裁条款申请仲裁，另一方在仲裁庭首次开庭前对仲裁协议的效力提出异议，仲裁申请通常会被驳回。
   • 此时，当事人需要向有管辖权的法院提起诉讼，通过民事诉讼流程来解决争议。

2. 一方申请仲裁，另一方未提出异议：

   • 若一方申请仲裁，另一方未在仲裁庭首次开庭前提出异议，则可能被视为接受仲裁管辖。
   • 在此情况下，仲裁协议可视为有效，后续纠纷将按照仲裁程序处理。但这种情况较为特殊，且存在法律风险，因为一旦另一方在后续过程中提出异议，仲裁程序可能会受到影响。

3. 仲裁协议无效后的管辖确定：

   • 当仲裁协议被认定为无效后，若一方起诉至法院，法院一般会受理该案件。
   • 管辖法院通常按照法定管辖规则确定，如合同纠纷由被告住所地或合同履行地人民法院管辖。当事人也可根据书面协议选择被告住所地、合同履行地等与争议有实际联系地点的法院管辖，但不得违反级别管辖和专属管辖的规定。

三、建议与注意事项

1. 明确约定纠纷解决方式：在签订合同时，应明确约定纠纷解决方式，避免同时约定仲裁和诉讼，以免导致仲裁协议无效和争议解决途径不明确。

2. 及时提出异议：若一方依据无效的仲裁协议申请仲裁，另一方应及时在仲裁庭首次开庭前提出异议，以避免不必要的仲裁程序和法律风险。

3. 寻求专业法律帮助：在处理合同纠纷时，建议寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到妥善保护。

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