双方约定了仲裁协议但实际到法院应诉，仲裁协议是否还有效，需分情况讨论：
若一方在首次开庭前提交了有效的仲裁协议，且未出现仲裁协议无效的情形：
- 根据《仲裁法》及相关司法解释，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉而未声明有仲裁协议，人民法院受理后，另一方在首次开庭前提交仲裁协议的，人民法院应当驳回起诉，但仲裁协议无效的除外。这意味着，如果仲裁协议是有效的，且另一方在首次开庭前及时提出了异议并提交了仲裁协议，那么法院将不会继续审理该案件，而是会驳回起诉，仲裁协议仍然有效。
若另一方在首次开庭前未对人民法院受理该案提出异议，或仲裁协议存在无效情形：
- 同样根据《仲裁法》及相关司法解释，另一方在首次开庭前未对人民法院受理该案提出异议的，视为放弃仲裁协议，人民法院应当继续审理。此外，如果仲裁协议存在无效情形（如无民事行为能力人或者限制民事行为能力人签订的仲裁协议、约定的仲裁事项超出了仲裁的范围、仲裁协议对仲裁委员会没有约定或者约定不明且当事人又达不成补充协议的、一方采取胁迫手段迫使对方订立的仲裁协议、当事人口头订立的仲裁协议等），那么仲裁协议将无效，法院将继续审理案件。这意味着，在这种情况下，仲裁协议将不再有效，案件将由法院进行审理。
法律背景与建议：
- 仲裁协议是当事人之间约定将争议提交给仲裁机构进行裁决的书面协议。它具有独立性，即合同的变更、解除、终止、转让、失效、无效、未生效、被撤销以及成立与否，均不影响仲裁条款或仲裁协议的效力。然而，仲裁协议的有效性也受到严格限制，必须满足法定条件（如具有明确的请求仲裁的意思表示、仲裁事项和选定的仲裁委员会等）。
- 在实际操作中，如果双方约定了仲裁协议但实际到法院应诉，建议当事人及时审查仲裁协议的有效性，并在首次开庭前根据实际情况决定是否提出异议。如果认为仲裁协议有效且希望通过仲裁解决争议，应及时向法院提交仲裁协议并提出异议；如果认为仲裁协议无效或希望直接通过诉讼解决争议，则应做好应诉准备。
可能产生的法律后果：
- 如果仲裁协议有效且另一方及时提出了异议，法院将驳回起诉，案件将进入仲裁程序。这可能导致诉讼成本的增加和诉讼时间的延长。
- 如果仲裁协议无效或另一方未提出异议，法院将继续审理案件并作出判决。这可能导致仲裁协议的目的无法实现，且当事人可能需要承担更高的诉讼风险和成本。
因此，在签订仲裁协议时，当事人应谨慎考虑并确保协议的有效性。在发生争议时，也应及时根据实际情况采取适当的法律措施以维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。