在约定了有效的仲裁条款后，仲裁条款仍然有效，当事人一般应通过仲裁解决争议，而不能向法院起诉。但在特定情况下，如仲裁条款无效、双方放弃仲裁协议或仲裁裁决被撤销或不予执行时，当事人可以向法院提起诉讼。以下是对这一问题的详细分析：

一、仲裁条款的效力与选择

双方当事人如果在合同中约定了仲裁条款，或者事后达成了书面仲裁协议，并且该仲裁事项属于法律规定的可仲裁范围，那么当发生争议时，应当按照约定申请仲裁，而不是向法院提起诉讼。这是因为仲裁和诉讼是并列的两种解决争议的方式，它们各自有独立的程序和规则。一旦选择了仲裁，就意味着接受了仲裁的规则和程序，以及仲裁裁决的结果。有效的仲裁条款具有排除法院司法管辖权的法律效力，即如果当事人之间已经存在有效的仲裁条款，那么当出现约定范围内的争议时，应当通过仲裁途径解决，而不能再向法院起诉。

二、仲裁条款无效的情形

尽管仲裁条款具有排除法院司法管辖权的效力，但在以下特殊情况下，仲裁条款可能无效，当事人可以向法院提起诉讼：

1. 约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围：例如，涉及人身关系的纠纷（如婚姻、收养、监护等）通常不属于仲裁范围。
2. 无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议：这类主体由于缺乏完全民事行为能力，其订立的仲裁协议可能被视为无效。
3. 一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议：如果仲裁协议是在一方胁迫下订立的，那么该协议可能被视为无效。
4. 仲裁协议对仲裁事项或仲裁委员会没有约定或者约定不明确，且双方当事人达不成补充协议的：根据《仲裁法》的相关规定，仲裁协议应当具有明确性，包括明确的仲裁事项和选定的仲裁委员会。如果仲裁协议缺乏这些要素，且双方无法达成补充协议，那么该仲裁协议可能被视为无效。

三、双方放弃仲裁协议的情形

双方当事人可以通过明示或默示的方式放弃仲裁协议。例如，在仲裁程序启动前，双方一致同意将争议提交法院解决，或者以实际行动表明不再履行仲裁协议（如一方已经向法院提起诉讼，且另一方未提出异议并应诉），那么此时当事人可以向法院起诉。

四、仲裁裁决被撤销或不予执行的情形

如果仲裁裁决作出后，该裁决被有管辖权的法院依法撤销或者裁定不予执行，那么当事人可以就该争议向法院提起诉讼。这是因为在这种情况下，仲裁裁决已经失去了法律效力，当事人需要通过其他途径解决争议。

五、建议与注意事项

1. 明确仲裁条款：在签订合同时，当事人应明确约定仲裁条款，包括仲裁事项、选定的仲裁委员会等关键要素，以确保仲裁条款的明确性和有效性。
2. 了解仲裁与诉讼的区别：在选择解决争议的方式时，当事人应充分了解仲裁和诉讼的特点和规则，根据自己的实际情况和需求做出合理的选择。
3. 保留相关证据和材料：在仲裁或诉讼过程中，当事人应保留好相关证据和材料，以便在必要时证明自己的主张或应对可能出现的特殊情况。

在实际操作中，如果当事人已经约定了有效的仲裁条款，就应当按照约定申请仲裁，并遵循仲裁的规则和程序。如果遇到特殊情况或疑问，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议。