合同中约定了仲裁条款，但仲裁条款无效时，合同本身的效力并不因此直接受到影响，合同是否有效需根据其他因素综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、仲裁条款无效与合同效力的关系
仲裁条款的独立性：
- 根据《中华人民共和国仲裁法》第十九条：“仲裁协议独立存在，合同的变更、解除、终止或者无效，不影响仲裁协议的效力。”这一规定确立了仲裁条款的独立性原则，即仲裁条款与合同实体内容在法律效力上是相互独立的。然而，这一原则主要强调的是合同实体内容的变化不影响仲裁条款的效力，但反过来，仲裁条款的无效并不直接决定合同的效力。
合同效力的判断依据：
- 合同的效力主要取决于合同是否满足法律规定的生效要件，如当事人是否具有相应的民事行为能力、意思表示是否真实、合同内容是否合法且不违背公序良俗等。因此，即使仲裁条款无效，合同本身仍可能因满足其他生效要件而有效。
二、仲裁条款无效的情形及对合同的影响
仲裁条款无效的情形：
- 仲裁条款可能因约定不明确（如未约定明确的仲裁机构）、仲裁事项超出法律规定范围、当事人不具备行为能力、违反法律强制性规定或社会公序良俗等原因而无效。
对合同效力的影响：
- 仲裁条款的无效并不直接导致合同无效。合同是否有效仍需根据上述合同生效要件进行判断。例如，若合同因内容违法而被认定无效，那么无论仲裁条款是否有效，合同都将被视为无效。但若合同本身合法有效，仅因仲裁条款存在瑕疵而无效，则不影响合同的效力。
三、实际案例分析
- 案例一：甲乙双方签订了一份买卖合同，并约定了仲裁条款。后因合同内容违反了法律的强制性规定，该买卖合同被法院认定无效。在此情况下，仲裁条款也因与合同无效的根本原因紧密相关而被视为无效。但合同无效的原因是内容违法，而非仲裁条款本身，因此合同无效与仲裁条款无效是两个独立的事实。
- 案例二：丙丁双方签订了一份服务合同，并约定了仲裁条款。后因仲裁条款中约定的仲裁机构不明确，导致仲裁条款无效。但服务合同本身并不存在其他违法或违背公序良俗的情形，且双方意思表示真实，因此服务合同仍然有效。双方需通过诉讼等其他方式解决争议。
四、法律建议
审查合同及仲裁条款：
- 在签订合同时，应仔细审查合同内容及仲裁条款，确保合同合法有效且仲裁条款明确、合法。
咨询专业律师（此条根据要求调整为）：
- 若您对合同或仲裁条款的效力存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供针对性的法律意见。
选择合适的争议解决方式：
- 若仲裁条款无效或您不愿通过仲裁解决争议，可以考虑通过诉讼、调解等其他方式解决争议。
综上所述，合同中约定了仲裁条款但仲裁条款无效时，合同本身的效力并不因此直接受到影响。合同是否有效需根据其他因素综合判断。若您在此方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。