在行政处罚案件中，违法所得已退赔的，是否还要没收，需结合具体法律法规及案件情况来判断，一般情况下，违法所得仍可能面临没收，但存在例外情形。以下从不同角度进行分析：

一、法律法规的一般规定

根据《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律法规，行政机关在查处违法行为时，有权依法没收违法所得。这里的“违法所得”通常指的是因违法行为而获得的全部收入，包括但不限于直接收入和间接收入。退赔违法所得，即违法者将其因违法行为获得的利益返还给受损方，是违法者承担民事责任的一种方式。然而，退赔并不等同于行政处罚中的没收，两者在性质、目的和程序上均存在显著差异。

1. 性质差异：退赔是民事责任的一种体现，旨在恢复受损方的合法权益；而没收则是行政处罚的一种，旨在惩罚违法行为，防止其再次发生。
2. 目的不同：退赔侧重于补偿，即让受损方得到应有的赔偿；没收则侧重于惩罚和预防，通过剥夺违法者的非法利益，达到警示和教育的目的。
3. 程序区别：退赔通常通过民事诉讼或协商解决，而没收则需通过行政处罚程序进行。

二、是否没收的判断因素

在行政处罚案件中，即使违法所得已退赔，行政机关仍可能根据具体情况决定是否没收。这主要取决于以下因素：

1. 法律法规的具体规定：不同法律法规对违法所得的处理方式可能存在差异。有些法律可能明确规定，即使违法所得已退赔，仍需没收；而有些法律则可能未作此规定。
2. 违法行为的性质和情节：对于性质恶劣、情节严重的违法行为，行政机关可能更倾向于没收违法所得，以彰显法律的威严和惩罚力度。
3. 退赔的完整性和及时性：如果违法者能够及时、完整地退赔违法所得，且态度诚恳，行政机关可能会考虑减轻或免除没收处罚。但这并非绝对，还需结合其他因素综合判断。

三、例外情形

在某些特定情况下，即使存在违法所得，行政机关也可能不予以没收。例如：

1. 法律明确规定免除没收：如果相关法律法规明确规定，在特定条件下可免除没收违法所得，则行政机关应遵守该规定。
2. 违法所得已无法追回或已用于公益：在某些情况下，违法所得可能已无法追回（如已被挥霍一空）或已用于公益事业（如捐赠给慈善机构）。此时，行政机关可能会考虑不予以没收。
3. 违法者配合调查且情节轻微：如果违法者能够积极配合行政机关的调查工作，且违法行为情节轻微、社会危害性较小，行政机关可能会考虑不予以没收或减轻处罚。

四、法律建议

1. 对于违法者而言：在面临行政处罚时，应积极配合行政机关的调查工作，及时、完整地退赔违法所得，并主动承担其他法律责任。同时，可咨询专业律师，了解自身权益和可能的法律后果。
2. 对于行政机关而言：在作出没收决定时，应充分考虑法律法规的具体规定、违法行为的性质和情节以及退赔的完整性和及时性等因素。确保处罚决定合法、合理、公正。

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