在行政案件中，已经退还了违法所得，一般情况下执法机关不再重复没收，但若存在退还不彻底或未有效确认等情况，执法机关仍有权决定是否继续采取没收等措施。以下是对此问题的详细分析：

一、退还违法所得与没收违法所得的性质

1. 退还违法所得：这是违法者主动将因违法行为获取的财物归还原主的行为，旨在弥补受害者的损失。这种行为体现了违法者的一定悔罪态度，有助于恢复被破坏的社会关系。

2. 没收违法所得：这是执法机关强制收缴违法者因违法行为获取的财物的行为，目的是剥夺违法者的不当经济利益，防止其继续从违法行为中获利。

二、退还违法所得后是否还会被没收

1. 一般情况下不再没收：

   • 当违法者已主动退还违法所得，且退还行为得到了有效确认时，执法机关通常不再重复没收。因为此时违法所得已脱离违法者的控制，并回归了应有的状态，没收已无实际意义。

2. 存在退还不彻底或未有效确认时可能继续没收：

   • 如果退还不彻底，即违法者未将全部违法所得退还，或者退还行为未得到有效确认，执法机关有权根据具体情况决定是否继续采取没收等措施。
   • 例如，在执法机关不知情的情况下，违法者虽声称已退还违法所得，但实际并未退还或退还不足，此时执法机关仍有权进行没收。

三、退还违法所得后的法律后果

1. 行政处罚角度：

   • 退还违法所得可作为从轻或减轻处罚的考量因素。在行政处罚中，执法机关可能会根据违法者的退赃情况，对其处以警告、罚款等相对较轻的处罚。
   • 但若违法行为情节严重，即使违法者已退还违法所得，执法机关仍可能施以其他处罚，如吊销许可证、责令停产停业等，以达到惩戒的目的。

2. 刑事处罚角度（虽行政案件不直接涉及，但为全面理解提供参考）：

   • 在刑事案件中，退还违法所得同样是从轻量刑的情节之一。但只要构成犯罪，违法者就必须接受相应刑罚。
   • 犯罪行为对社会秩序、公共安全或他人权益造成严重损害时，不能仅因退还违法所得就免除刑事处罚。

四、建议与注意事项

1. 违法者应彻底退还违法所得：

   • 为避免被继续没收或面临更严重的法律后果，违法者应确保彻底退还违法所得，并保留好相关证据，如退还凭证、受害者收据等。

2. 与执法机关保持沟通：

   • 在退还违法所得后，违法者应主动与执法机关沟通，说明退还情况，并请求执法机关出具相关确认文件，以证明退还行为的有效性。

3. 寻求法律帮助：

   • 如果对退还违法所得后的法律后果存在疑问或担忧，违法者可以寻求专业律师的法律帮助，以了解自己的权利和义务，并制定合适的应对策略。

如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业、全面的法律服务。