结论前置：员工未打卡但可以证明未缺勤的情况下，公司一般无权扣钱，但具体还需根据公司的规章制度以及该制度的合法性和合理性来判断。
一、从法律原则角度分析
根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，且工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，除非有合法的依据，否则公司不能随意扣减员工的工资。在员工未打卡但能证明实际出勤的情况下，扣减工资缺乏合法依据，可能构成对劳动者合法权益的侵犯。
二、从公司规章制度角度分析
有合法有效的规章制度依据：
- 如果公司制定了明确的考勤制度，并且该制度经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）和公示或告知劳动者（如在公司内部公告栏公示、组织员工培训等），同时制度中明确规定了未打卡但能证明出勤情况下的处理方式，且该处理方式不违反法律法规的强制性规定，那么公司可以按照制度执行。但扣钱的金额应当合理，不能过分高于因未打卡可能给用人单位带来的损失，且扣除后劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。
- 示例：若公司考勤制度规定，未打卡但能提供有效出勤证明的，不视为缺勤，不扣减工资；或者规定扣减的金额相当于因未打卡可能给公司带来的管理成本（如一小时的工资），且扣除后工资仍高于最低工资标准，这种扣钱方式是合理的。
缺乏制度依据或未经法定程序制定：
- 若公司没有制定相关考勤制度，或制度的制定没有经过民主程序和公示告知程序，则扣钱行为缺乏合法依据。在这种情况下，公司无权仅凭未打卡记录就扣减员工的工资。
- 示例：公司突然宣布未打卡要扣钱，但此前无相关规定或未与员工协商、公示，此扣钱行为不合法。
三、从员工应对角度分析
- 积极沟通与提供证据：员工在遇到未打卡但被误认为缺勤的情况时，应积极与用人单位沟通，说明情况并提供相关证据，如同事证言、工作成果、监控视频等，以证明自己实际出勤并履行了工作职责。
- 寻求法律途径：如果双方协商不成，员工可以寻求劳动争议调解或仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。例如，向人社局的劳动监察大队举报投诉，要求查处公司无故扣减工资的行为；或者依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求支付被非法扣除的工资及赔偿金。
四、特殊情况说明
- 如果员工未打卡是因为未出勤或违反了其他工作规定：在这种情况下，公司有权根据考勤制度和绩效考核制度适度扣除部分绩效工资。但扣除的工资不能超过员工当月工资的20%，且扣减后的工资不得低于当地月最低工资标准。
建议：公司应当建立完善合理的考勤制度，对于未打卡的情况设定合理的补卡流程或说明机制，并确保制度的制定程序合法且已公示告知员工。员工也应积极了解公司的规章制度，并在遇到问题时及时与用人单位沟通或寻求法律途径解决。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。