员工离职后，若公司扣留其证件，员工应向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。以下是对此问题的详细分析：
一、公司扣留员工证件的合法性分析
首先，我们需要明确的是，公司扣留员工证件的行为通常是不合法的。员工证件，如身份证、学历证、职业资格证等，属于员工个人财产，公司无权扣留。这种行为可能侵犯了员工的财产权和个人信息权。
二、员工应如何维权
向劳动监察部门投诉：
- 员工可以向当地劳动监察部门投诉公司的违法行为。劳动监察部门是负责监督用人单位遵守劳动法律法规的机构，他们有权对公司的违法行为进行调查和处理。
- 投诉时，员工应提供相关证据，如扣留证件的证明、与公司沟通的记录等，以便劳动监察部门能够更准确地了解情况并作出处理。
申请劳动仲裁：
- 如果劳动监察部门未能及时解决问题，或者员工对劳动监察部门的处理结果不满意，员工可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。
- 劳动仲裁是一种法律程序，通过仲裁庭的裁决来解决劳动争议。在仲裁过程中，员工需要提供充分的证据来证明公司的违法行为，并请求仲裁庭裁决公司归还证件并可能承担其他法律责任。
三、可能面临的法律后果
- 如果公司被认定扣留员工证件的行为违法，公司可能需要承担归还证件、赔偿员工损失等法律责任。
- 在某些情况下，如果公司的行为构成对员工权益的严重侵犯，员工还可以考虑向法院提起诉讼，要求公司承担更严重的法律责任。
四、建议与注意事项
- 保留证据：员工在离职过程中应保留好与公司的沟通记录、扣留证件的证明等相关证据，以便在维权时能够提供有力的支持。
- 及时维权：员工在发现公司扣留证件后，应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以免错过维权时机。
- 咨询专业律师：虽然在此问题中我作为律师给出了建议，但在实际操作中，如果员工对法律程序不熟悉或遇到复杂情况，建议咨询专业律师以获取更准确的法律指导。
综上所述，员工在离职后若发现公司扣留其证件，应通过向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁的方式来维护自己的权益。同时，员工在维权过程中应保留好相关证据，并及时咨询专业律师以获取更准确的法律指导。