双休变单休，若用人单位未与劳动者协商一致擅自变更，劳动者确实有权申请劳动仲裁以维护自身权益。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律依据与合同变更原则
《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条：该条款明确规定，用人单位与劳动者需协商一致方可变更劳动合同内容，且变更应采用书面形式。这意味着，任何对劳动合同内容的实质性变动，包括工作时间的变更，都需双方同意并书面确认。若用人单位未经协商擅自变更，则构成违法。
《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条：此条款指出，违反法律、行政法规强制性规定的劳动合同无效或部分无效。若用人单位单方面改变工作时间安排，违反了劳动合同的约定或法律法规，该变更可能被视为无效。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条：该条款明确了因劳动合同订立、履行、变更等发生的争议均适用该法。这为劳动者提供了申请仲裁的法律基础，即当用人单位擅自变更劳动合同内容时，劳动者有权申请仲裁。
二、双休变单休的合法性分析
劳动合同明确约定双休：若劳动合同中已明确约定工作时间为双休，用人单位未经协商和劳动者同意擅自改为单休，构成对劳动合同内容的违法变更。此时，劳动者有权申请仲裁，要求用人单位恢复原工作时间安排或给予相应补偿。
工作时长与休息权益：即使劳动合同未明确写明双休，但根据《中华人民共和国劳动法》，劳动者享有休息休假的权利，用人单位应保障劳动者每周至少休息一日。若变更工作时间导致劳动者休息时间减少，且未依法支付加班费或补偿，同样构成对劳动者权益的侵害。此时，劳动者也可申请仲裁。
特殊情况：若公司执行做六休一但确保每周工作时长不超过44小时（根据《劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度），且依法缴纳社保、发放加班工资，则不构成对劳动者权益的侵害。在这种情况下，劳动者不能仅凭此理由申请仲裁。
三、申请仲裁的注意事项
证据收集：劳动者在申请仲裁前，应充分收集相关证据，包括但不限于劳动合同、工资条、考勤记录、工作证以及用人单位关于变更工作时间的通知等。这些证据将有助于证明用人单位的单方面变更行为及由此造成的损害。
仲裁程序：劳动者需向当地劳动仲裁委员会提交仲裁申请，并按照要求提供相应证据材料。劳动仲裁机构将依据双方提供的证据和法律规定进行公正裁决。若对裁决结果不服，劳动者还可依法向人民法院提起诉讼。
四、可能的法律后果
若用人单位擅自变更工作时间安排且未依法保障劳动者休息权益，可能面临以下法律后果：
恢复原工作时间安排：劳动仲裁机构或人民法院可能裁决用人单位恢复原工作时间安排，即恢复双休制度。
支付加班费或补偿：若变更工作时间导致劳动者休息时间减少且未依法支付加班费或补偿，用人单位可能需支付相应的加班费或补偿。
赔偿损失：若用人单位的违法行为给劳动者造成其他损失（如精神损失、交通费用等），还可能需承担相应的赔偿责任。
总结：双休变单休是否合法，关键在于用人单位是否遵循了法律规定的程序和要求，以及是否充分保障了劳动者的合法权益。若用人单位未经协商擅自变更工作时间，或变更后未能依法保障劳动者休息权益，劳动者均有权依法申请劳动仲裁以维护自身权益。在申请仲裁时，劳动者应注重证据的收集和整理，以确保仲裁请求得到支持。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。