合伙人签署的股份转让协议，即使未做工商变更，该协议也是具有法律效力的。以下从不同角度为您详细分析：

协议生效的法律依据

根据《民法典》的相关规定，民事法律行为有效需满足以下条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力；
2. 意思表示真实；
3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。

只要股份转让协议满足上述条件，即双方当事人具备相应的民事行为能力，协议内容是双方真实意思的表示，且未违反法律法规的强制性规定，那么该协议就是合法有效的。工商变更登记并非协议生效的要件，而是对股权转让事实的一种公示方式。

工商变更登记的作用

工商变更登记主要是为了对外公示股权的变动情况，保护交易安全，维护市场秩序。它并不影响股份转让协议本身的效力。即使未进行工商变更登记，只要协议合法有效，双方当事人仍应依约履行各自义务。未进行工商变更登记，只是不能对抗善意第三人，即如果第三人因信赖工商登记信息而与相关方进行交易，可能受到法律保护。

实际操作中的建议

1. 及时办理工商变更登记：尽管工商变更登记不是协议生效的要件，但为了保障自身权益，避免不必要的法律风险，建议在签署股份转让协议后，及时办理工商变更登记手续。

2. 完善协议内容：在签署股份转让协议时，应确保协议内容完整、明确，包括但不限于转让股份的数量、价格、支付方式、违约责任等条款，以减少后续纠纷的可能性。

3. 保留相关证据：在协议履行过程中，应保留好相关证据，如转账记录、沟通记录等，以备不时之需。

可能的法律后果

如果未进行工商变更登记，且后续发生纠纷，可能会面临以下法律后果：

1. 难以对抗善意第三人：如前所述，未进行工商变更登记，不能对抗善意第三人。如果第三人因信赖工商登记信息而与相关方进行交易，可能受到法律保护，导致原股份转让协议的履行受到阻碍。

2. 承担违约责任：如果因未进行工商变更登记而导致协议无法履行或产生其他损失，违约方可能需要承担相应的违约责任。

结论：合伙人签署的股份转让协议，即使未做工商变更，也是具有法律效力的。但为了保障自身权益，避免不必要的法律风险，建议及时办理工商变更登记手续，并完善协议内容、保留相关证据。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。