若老板在工厂上班时无合理缘由扣除员工工资，员工有权通过法律途径维权，是可以告他的。依据现行法律，用人单位克扣劳动者工资属违法行为，劳动者可通过以下途径来维护自身权益：
与老板沟通：
- 首先，员工应尝试与老板进行沟通，要求其阐述扣工资的合理依据，并补发工资。这是解决纠纷的最直接方式，有助于双方理解彼此立场，可能避免进一步的法律程序。
向劳动监察部门投诉：
- 若沟通无果，员工可向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查，并责令其在规定期限内支付工资。这是行政途径，相对快速且有效。
申请劳动仲裁：
- 若投诉后问题仍未解决，员工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁是劳动争议处理的必经前置程序，员工需准备好相关证据，如劳动合同、工资条、扣工资通知等，以证明劳动关系和扣工资事实。仲裁委员会将根据事实和法律作出裁决。
提起诉讼：
- 若对仲裁结果不服，员工可在规定时间内向有管辖权的人民法院提起诉讼。诉讼是最终的司法救济途径，法院将全面审查案件事实，并依法作出判决。
在维权过程中，员工需特别注意以下几点：
- 保存证据：员工应妥善保存与劳动关系和扣工资事实相关的所有证据，如劳动合同、工资条、扣工资通知、沟通记录等。这些证据是维权的基础，对于证明案件事实至关重要。
- 了解法律程序：员工应了解劳动争议处理的法律程序，包括投诉、仲裁和诉讼等。这有助于员工在维权过程中保持主动，避免因程序错误而影响维权效果。
- 寻求专业帮助：虽然员工可以自行维权，但在涉及复杂法律问题时，寻求专业律师的帮助可能更为有效。律师可以提供专业的法律意见和代理服务，帮助员工更好地维护自身权益。
若员工面临老板扣工资的情况，且对维权流程、所需材料或其他相关问题存在疑问，可以直接向我咨询。我将根据具体情况提供详细的法律建议和指导。