结论：公司倒查考勤以代打为由开除员工，员工是否有赔偿取决于代打卡行为是否构成严重违反公司规章制度以及公司解除劳动合同的程序是否合法。

一、代打卡行为是否构成严重违反公司规章制度

1. 若代打卡行为构成严重违反公司规章制度：

   • 根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
   • 在此情况下，公司以代打卡为由开除员工，员工无权要求赔偿。但前提是公司必须能够证明代打卡行为确实存在，且该行为严重违反了公司的规章制度。

2. 若代打卡行为不构成严重违反公司规章制度，或公司无法证明代打卡行为存在：

   • 如果公司无法证明代打卡行为确实存在，或者该行为并不构成严重违反公司规章制度，那么公司以此为由开除员工可能构成违法解除劳动合同。
   • 根据《劳动合同法》第四十八条和第八十七条，用人单位违法解除劳动合同的，应当依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。

二、公司解除劳动合同的程序是否合法

1. 若公司解除劳动合同的程序合法：

   • 公司在解除劳动合同前，应当事先将理由通知工会（如有工会）。如果工会认为公司的解除行为不适当，有权提出意见。
   • 如果公司能够证明其解除劳动合同的程序合法，且代打卡行为确实构成严重违反公司规章制度，那么员工无权要求赔偿。

2. 若公司解除劳动合同的程序不合法：

   • 如果公司未事先将解除理由通知工会，或者工会提出意见后公司未予以考虑，那么公司的解除行为可能构成违法解除劳动合同。
   • 在此情况下，员工有权要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。

三、建议与注意事项

• 对于员工：如果认为公司的开除行为不合法，可以收集相关证据（如考勤记录、公司规章制度、解除劳动合同的通知等），并向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付赔偿金。
• 对于公司：在解除劳动合同前，应当确保有充分的证据证明员工的代打卡行为确实存在，且该行为严重违反了公司的规章制度。同时，应当按照法定程序进行解除，避免违法解除劳动合同的风险。

举例说明：假设某公司规章制度中明确规定代打卡行为属于严重违反规章制度的行为，且公司能够提供充分的证据证明某员工存在代打卡行为。在此情况下，公司以此为由开除该员工是合法的，员工无权要求赔偿。但如果公司无法提供充分证据证明代打卡行为存在，或者该行为并不构成严重违反规章制度，那么公司以此为由开除员工可能构成违法解除劳动合同，员工有权要求赔偿。

总结：公司倒查考勤以代打为由开除员工是否有赔偿，取决于代打卡行为是否构成严重违反公司规章制度以及公司解除劳动合同的程序是否合法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。