公司开除员工并扣除周末工资的行为，通常是不合法的，员工有权要求公司支付被扣除的工资，并可能获得相应的赔偿。以下从不同角度为你详细分析：
一、公司开除员工的合法性
合法开除：如果员工存在严重违反公司规章制度、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损害等情形，公司有权依据《劳动合同法》的相关规定合法开除员工，且无需支付经济补偿。但即便如此，公司也应支付员工应得的工资，包括周末工资（如果周末属于正常工作时间或已安排加班并应支付加班费）。
非法开除：如果公司无正当理由开除员工，如因员工提出合理诉求、拒绝违法指令等而开除，则构成非法开除。此时，员工不仅有权要求公司支付被扣除的工资，还有权要求公司支付经济补偿金或赔偿金。
二、扣除周末工资的合法性
正常工作时间：如果周末属于员工的正常工作时间（如实行轮班制或周末为正常工作日），则公司应支付员工周末的工资。扣除周末工资属于违法行为。
加班工资：如果周末属于员工的休息日，但员工被安排加班，则公司应按照《劳动法》的规定支付加班费（通常为正常工资的两倍）。扣除加班费同样属于违法行为。
三、员工应采取的措施
与公司协商：首先，员工可以尝试与公司进行协商，要求公司支付被扣除的工资，并解释相关法律法规。如果公司同意支付，则问题得到解决。
申请劳动仲裁：如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司支付被扣除的工资及可能的赔偿金。劳动仲裁是解决劳动争议的一种有效方式，且仲裁结果具有法律效力。
提起诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，员工还可以向法院提起诉讼，要求公司承担法律责任。在诉讼过程中，员工需要提供相关证据证明公司的违法行为。
四、可能的法律后果
支付工资及赔偿金：如果公司被认定存在违法行为，如非法开除员工或扣除周末工资，则公司需要支付员工被扣除的工资及可能的赔偿金。赔偿金的数额通常根据员工的工资水平、工作年限及公司的过错程度等因素确定。
行政处罚：除了承担民事责任外，公司还可能面临劳动行政部门的行政处罚，如罚款、责令改正等。
建议：如果你遇到公司开除并扣除周末工资的情况，建议先收集相关证据（如劳动合同、工资条、开除通知等），然后与公司进行协商。如果协商无果，可以及时向劳动仲裁机构申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。