同一借款人但担保人不同的情况下，案件通常可以合并起诉，但需满足一定条件。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与原则
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人一方或者双方为二人以上，其诉讼标的是共同的，或者诉讼标的是同一种类、人民法院认为可以合并审理并经当事人同意的，为共同诉讼。合并审理旨在提高诉讼效率，减少当事人诉累，节约司法资源。
二、合并审理的条件
诉讼标的相同或同类：
- 在借款纠纷中，如果多个案件的借款主体相同，即使担保人不同，只要诉讼标的（即借款本金、利息等）相同或属于同一种类，就有可能符合合并审理的条件。
法院认为可以合并审理：
- 法院会根据案件的具体情况，如案件性质、复杂程度、当事人意愿等因素，综合判断是否适合合并审理。
当事人同意：
- 合并审理需要得到当事人的同意。如果当事人对合并审理有异议，法院应尊重当事人的意见，不宜强行合并审理。
三、具体情形分析
普通共同诉讼：
- 如果多个借款纠纷案件虽然借款主体相同，但每个案件都有独立的法律关系（如不同的担保人），且这些法律关系之间不存在牵连关系，那么它们可能构成普通共同诉讼。在这种情况下，法院可以根据具体情况决定是否合并审理。
必要共同诉讼：
- 如果多个借款纠纷案件之间存在某种牵连关系，如基于同一份借款合同产生的多个担保责任纠纷，且这些纠纷必须一并解决才能避免矛盾判决的产生，那么它们可能构成必要共同诉讼。在这种情况下，法院应当合并审理。
四、注意事项
避免重复审理和矛盾判决：
- 合并审理可以避免对同一事实进行重复审理，防止产生矛盾判决，提高司法效率。
保障当事人合法权益：
- 在合并审理过程中，法院应充分保障当事人的诉讼权利，确保当事人能够充分发表自己的意见和主张。
担保方式的影响：
- 需要注意的是，担保方式（一般保证或连带责任保证）也可能影响合并起诉的可行性。例如，在一般保证下，债权人通常不能直接同时起诉借款人和保证人，除非存在特定情形（如债务人下落不明且无财产可供执行等）。而在连带责任保证下，债权人可以同时起诉借款人和担保人。
五、建议与操作
- 审查保证合同：债权人应首先审查保证合同，明确保证方式是一般保证还是连带责任保证，这是决定能否同时起诉借款人和担保人的关键。
- 注意保证期间：债权人需在保证期间内主张权利，否则保证人可能免除保证责任。
- 确定管辖法院：债权人应确定有管辖权的法院，通常是被告住所地或合同履行地法院，以确保诉讼的有效进行。
- 全面保护债权：同时起诉借款人和担保人有助于更全面地保护债权人的利益，提高诉讼效率，并促进法院更全面地审理案件，做出公正的裁决。
在实际操作中，如果您面临此类问题，建议根据具体情况咨询专业律师，以确保您的权益得到充分保障。如果您还有其他关于债务债权方面的法律问题，也可以直接向我咨询。