老板在发工资时擅自更改底薪，这一行为是否合法，需分情况讨论：
若劳动合同中有明确约定底薪，且未经劳动者同意擅自更改，则不合法。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。这意味着，若劳动合同中已明确约定了底薪，用人单位未经劳动者同意，单方面更改底薪，违反了法律规定。
- 法律后果：劳动者有权要求用人单位按照原劳动合同约定的底薪支付工资。若用人单位拒绝，劳动者可以向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁，要求用人单位支付差额工资及可能的赔偿金。
若劳动合同中未明确约定底薪，或双方协商一致后更改底薪，则可能合法。
- 法律依据：在劳动合同未明确约定底薪的情况下，用人单位与劳动者可以就底薪进行协商，并达成一致意见。此时，更改底薪的行为是合法的。另外，若双方协商一致，并采用书面形式变更了劳动合同中的底薪条款，那么更改底薪的行为也是合法的。
- 注意事项：即使在这种情况下，用人单位也应确保更改底薪的行为不会违反最低工资标准等法律法规。同时，劳动者在签署任何变更劳动合同的协议前，应仔细阅读并理解协议内容，确保自己的权益不受损害。
建议与提醒：
- 保留证据：无论何种情况，劳动者都应保留好与用人单位签订的劳动合同、工资条、银行转账记录等证据，以备不时之需。
- 及时沟通：若发现用人单位擅自更改底薪，劳动者应及时与用人单位沟通，表达自己的异议，并要求用人单位按照原劳动合同履行义务。
- 寻求法律帮助：若沟通无果，劳动者可以向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁，甚至通过诉讼途径维护自己的合法权益。
总结：老板在发工资时擅自更改底薪的行为是否合法，取决于劳动合同中的约定以及双方是否协商一致。若劳动合同中有明确约定且未经劳动者同意擅自更改，则不合法；若劳动合同中未明确约定或双方协商一致后更改，则可能合法。但无论如何，劳动者都应保留好相关证据，及时沟通并寻求法律帮助以维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。