老板拖欠农民工工资跑了且已上诉法院，后续可走的程序主要包括申请强制执行及参与执行过程中的相关程序，以下为你详细阐述：
一、申请强制执行
申请条件：
- 法院已作出判决，要求老板支付拖欠的工资及可能的经济补偿。
- 判决已生效，即过了上诉期且没有上诉，或者上诉后二审已作出终审判决。
- 老板未在判决规定的期限内履行支付义务。
申请流程：
- 准备材料：包括强制执行申请书、生效的法律文书（如判决书）、申请人的身份证明等。
- 提交申请：将准备好的材料提交给作出判决的法院的执行局。
- 缴纳费用：根据法院的要求缴纳执行费用。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，发生法律效力的民事判决、裁定，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行。
二、参与执行过程
法院查询财产：
- 法院受理强制执行申请后，会查询老板名下的财产，包括银行存款、房产、车辆等。
财产处置：
- 若查询到老板有可供执行的财产，法院会进行查封、扣押、冻结，并通过拍卖、变卖等方式处置这些财产。
- 处置所得款项将用于支付劳动者的工资及可能的经济补偿。
执行异议与救济：
- 若老板对执行行为有异议，可以提出执行异议。
- 若劳动者认为执行行为违法或侵害其权益，也可以依法提出异议或申请救济。
三、注意事项与建议
- 及时申请：判决生效后，应尽快申请强制执行，以免老板转移财产导致执行困难。
- 提供线索：在执行过程中，应积极向法院提供老板的财产线索，以便法院更有效地执行。
- 关注进展：定期向法院了解执行进展，确保自己的权益得到及时维护。
- 法律援助：若在执行过程中遇到困难或问题，可以寻求法律援助或咨询专业律师（比如我，黄兆麟律师，就非常擅长处理这类劳动纠纷问题）。
举例说明：假设农民工小张因老板拖欠工资而起诉至法院，法院判决老板支付工资及经济补偿。但判决生效后，老板未履行支付义务且跑路。此时，小张可以向法院申请强制执行，法院会查询老板名下的财产并进行处置。若处置所得款项足以支付小张的工资及经济补偿，则小张的权益将得到维护。
后续可能面临的法律后果：若老板拒不履行法院判决且未提出合法异议，法院可以采取罚款、拘留等强制措施；情节严重的，还可能构成拒不执行判决、裁定罪，依法追究刑事责任。
希望以上解答能对你有所帮助。若你还有其他关于劳动纠纷的问题，欢迎直接向我咨询。