针对机关人员没有出编文件和出编记录，但现领导不认在编的情况，法律上主要从以下几个方面进行处理：

1. 核实编制身份的依据：

   • 编制身份通常通过出编文件、出编记录或相关的人事档案材料来确认。若机关人员确实没有这些直接文件，应首先尝试通过其他途径来核实其编制身份，如查阅历史的人事调动记录、工资发放记录、社保缴纳记录等，这些都可以作为间接证据来证明其编制身份。
   • 若机关内部有完善的人事管理系统或档案库，也可以从中查询相关记录，以确认该人员的编制状态。

2. 与现领导进行沟通协商：

   • 在确认了编制身份的依据后，应与现领导进行坦诚的沟通，说明情况并提供相关证据。通过协商，看是否能够达成共识，并解决编制身份的认可问题。
   • 沟通时，应保持冷静和理性，避免情绪化的争执，以寻求问题的合理解决。

3. 寻求上级部门或人事主管部门的帮助：

   • 如果与现领导的沟通没有取得预期的效果，可以考虑向上级部门或人事主管部门反映情况，并请求他们介入调查和处理。
   • 上级部门或人事主管部门通常具有更高的权威性和处理能力，他们可以对编制身份进行进一步的核实和确认，并给出相应的处理意见。

4. 法律途径解决：

   • 如果通过上述途径仍然无法解决问题，且该人员的编制身份确实受到侵害，那么可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，要求确认自己的编制身份并恢复相应的待遇。
   • 在此过程中，应准备充分的证据来支持自己的主张，如人事档案材料、工资单、社保缴纳记录等。

5. 注意事项：

   • 在处理此类问题时，应确保所有行动都符合法律法规的规定，避免采取过激或违法的行为。
   • 同时，应保留好所有相关的证据和文件，以备不时之需。

法律背景：

• 编制身份是机关人员的重要权益之一，受到法律的保护。任何单位或个人都不得随意否认或剥夺他人的编制身份。
• 在处理编制身份争议时，应遵循公平、公正、公开的原则，确保所有相关人员的权益都得到妥善的维护。

建议：

• 在遇到此类问题时，建议首先通过内部沟通协商来解决。如果无法达成共识，再考虑寻求上级部门或人事主管部门的帮助。
• 如果问题仍然无法解决，且编制身份确实受到侵害，那么应及时通过法律途径来维护自己的权益。

可能的法律后果：

• 如果机关人员能够成功证明自己的编制身份，并恢复相应的待遇，那么将不会产生进一步的法律后果。
• 如果机关人员未能成功证明自己的编制身份，或者虽然证明了但未能恢复相应的待遇，那么可能会面临一定的经济损失和精神损害。在此情况下，可以通过法律途径来寻求赔偿和救济。