结论是：能否申请加班费，关键在于公司是否将周六、周日明确安排为加班日，并且是否支付了相应的加班费，同时需考虑劳动合同及公司规章制度的约定。 以下是详细分析：
一、加班费的法律依据
根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位安排劳动者在休息日（如周六、周日）工作，而又不能安排补休的，应当按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付劳动者工资。这意味着，如果公司确实将周六、周日作为工作日，并且没有安排补休，那么劳动者有权要求公司支付加班费。
二、劳动合同及公司规章制度的考量
劳动合同的约定：首先，需要查看劳动合同中是否对工作时间、加班及加班费有明确的约定。如果劳动合同中明确规定了周六、周日为正常工作日，并且约定了相应的加班费支付标准，那么劳动者可以依据合同要求公司支付加班费。
公司规章制度的规定：其次，如果劳动合同中没有明确约定，那么需要查看公司的规章制度。如果公司规章制度中明确规定了周六、周日为工作日，并且规定了加班费的支付方式，那么劳动者同样可以依据规章制度要求公司支付加班费。但需要注意的是，公司规章制度必须经过民主程序制定，并且已经向劳动者公示或告知，否则可能对劳动者不产生约束力。
三、实际操作的建议
与公司协商：如果发现公司未按照法律规定或合同约定支付加班费，劳动者可以先与公司进行协商，要求公司支付应得的加班费。
收集证据：在协商过程中，劳动者需要收集相关证据，如考勤记录、工资单、劳动合同或公司规章制度等，以证明自己确实在周六、周日工作，并且公司未支付加班费。
申请劳动仲裁：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司支付加班费。在申请劳动仲裁时，劳动者需要提交相关证据和仲裁申请书。
提起诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，劳动者还可以向法院提起诉讼，要求公司支付加班费及可能的赔偿金。
四、特殊情况的处理
如果公司虽然将周六、周日作为工作日，但已经通过调休等方式确保了劳动者的休息权益，并且已经支付了相应的工资（可能包含加班费的部分），那么劳动者可能无法再要求公司额外支付加班费。但这种情况需要具体分析劳动合同、公司规章制度以及实际支付情况等因素。
如果有任何关于劳动工伤（工资福利）方面的法律问题，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。