针对您提出的“雇主责任险中，保险公司因不是工伤拒赔是否合理”的问题，我们可以从法律框架、保险合同条款以及实际案例三个维度进行深入分析。
一、法律框架与保险合同条款
首先，雇主责任险是一种商业保险，其核心在于以雇主对雇员依法所负的赔偿责任为保险标的。这意味着，只要雇主对雇员的伤亡负有法律上的赔偿责任，且该伤亡情况符合保险合同约定的赔付条件，保险公司就应当承担赔付责任。
关键在于，保险合同中是否明确将“工伤认定”作为赔付的前提条件。从法律实践来看，如果保险合同并未明确约定工伤认定是赔付的必要条件，那么保险公司以“未认定工伤”为由拒赔，就缺乏合同依据。
二、实际案例分析
以您提供的案例为例，李某在上班途中发生非本人主要责任的交通事故死亡，食品公司（雇主）已与李某亲属达成赔偿和解协议，并支付了赔偿款。随后，食品公司基于雇主责任险向保险公司申请理赔，但保险公司以“未经工伤认定”为由拒绝赔付。
法院在审理此案时，重点审查了保险合同条款，发现合同中并未约定工伤认定是赔付的前提条件。因此，法院认定保险公司以“未认定工伤”为由拒赔是不合理的，判决保险公司应按合同约定在赔偿限额内予以赔付。
三、赔付责任的认定原则
在雇主责任险的赔付中，赔付责任的认定应严格按照保险合同约定。理赔时是否需要以工伤认定为前提，应结合合同条款要求及是否存在免责事由进行认定。如果合同中没有明确约定工伤认定是赔付的必要条件，那么保险公司就不能以此为由拒赔。
四、建议与风险提示
投保前：雇主在投保雇主责任险时，应仔细阅读保险合同条款，特别是关于赔付条件和免责事由的部分。确保合同内容符合自身需求，避免因合同条款不清而引发纠纷。
出险后：一旦发生雇员伤亡事件，雇主应及时报案并固定相关证据，如医疗记录、目击者证言等。这些证据对于后续理赔至关重要。
争议处理：如果与保险公司发生理赔纠纷，雇主可以通过协商、调解或诉讼等方式解决。在诉讼过程中，应重点收集“工作时间”、“工作岗位”以及“伤亡与工作相关”等证据，以支持自己的赔付请求。
综上所述，保险公司以“未认定工伤”为由拒赔雇主责任险，在合同未明确约定的情况下，是不合理的。雇主在投保和理赔过程中，应充分了解保险合同条款，确保自身权益得到保障。