工资关系和编制不在一起，可能会引发一系列法律和管理上的问题，具体影响及应对措施如下：
一、可能产生的问题
工资支付问题：
- 工资关系与编制分离，可能导致工资支付主体不明确，出现工资拖欠或支付错误的情况。例如，编制所在单位可能认为工资应由实际工作单位支付，而实际工作单位则可能以编制不在此为由拒绝支付。
- 这种情况下，员工可能面临维权困难，因为涉及两个或多个单位之间的责任划分问题。
社保与福利问题：
- 工资关系与编制不在一起，还可能影响员工的社保缴纳和福利待遇。不同单位可能按照不同的标准缴纳社保，导致员工社保权益受损。
- 福利待遇方面，如年终奖、节日福利等，也可能因编制与工资关系分离而受到影响，员工可能无法享受到与编制所在单位员工同等的待遇。
管理混乱与效率低下：
- 工资关系与编制分离，可能导致管理上的混乱。不同单位之间在人事管理、绩效考核等方面可能存在差异，导致员工在两个单位之间来回奔波，影响工作效率。
- 同时，这种分离也可能导致员工对单位的归属感降低，影响工作积极性和团队凝聚力。
二、法律建议与应对措施
明确工资支付主体：
- 员工应与编制所在单位和实际工作单位明确工资支付主体，签订书面协议，确保工资能够按时、足额支付。
- 如发生工资拖欠或支付错误的情况，员工应及时向相关单位主张权利，必要时可通过法律途径维权。
协调社保与福利待遇：
- 员工应与编制所在单位和实际工作单位协商，确保社保缴纳和福利待遇的连续性。如可能，应争取将社保关系和福利待遇统一至一个单位，以简化管理流程。
- 如无法统一，员工应了解并比较不同单位的社保和福利待遇标准，确保自己的权益不受损害。
加强沟通与协调：
- 员工应积极与编制所在单位和实际工作单位沟通，了解双方的管理要求和流程，确保自己能够适应并遵守相关规定。
- 如遇到管理上的问题或困难，员工应及时向相关单位反馈，寻求解决方案。
寻求法律援助：
- 如员工在工资关系与编制分离问题上遇到法律纠纷或维权困难，可寻求专业律师的法律援助。律师将根据员工的实际情况，提供针对性的法律建议和解决方案。
工资关系和编制不在一起可能引发工资支付、社保与福利、管理混乱等多方面的问题。员工应明确工资支付主体、协调社保与福利待遇、加强沟通与协调，并在必要时寻求法律援助，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。