编制和工资关系不在一个单位，退休时是否会有影响，这主要取决于具体的单位性质、政策规定以及个人的实际情况。以下从不同角度进行分析：

1. 单位性质与政策规定：

   • 公务员或事业单位：在公务员或事业单位体系中，编制通常与个人的职务、职级、工资待遇等紧密相关。如果编制和工资关系不在同一单位，可能会涉及到工资发放、社保缴纳、退休金计算等多个方面的问题。具体影响需根据当地政策、单位规定以及个人与单位的协商情况来确定。例如，某些地区或单位可能规定，退休金按照编制所在单位的标准计算，而工资则按照实际工作单位的标准发放，这种情况下，退休时可能会涉及到退休金与工资标准的衔接问题。
   • 企业单位：在企业单位中，编制的概念可能相对模糊，更多关注的是劳动合同、工资待遇等。如果工资关系与实际工作单位不一致，但劳动合同明确规定了工资发放、社保缴纳等事项，且单位能够按照合同约定履行义务，那么退休时可能不会受到太大影响。然而，如果存在劳动合同不明确、单位未履行义务等情况，则可能会影响到退休金的计算、社保的缴纳等。

2. 个人实际情况：

   • 社保缴纳情况：社保缴纳是影响退休金的重要因素之一。如果编制和工资关系不在同一单位，但个人在两个单位都正常缴纳了社保，且缴费年限、缴费基数等符合规定，那么退休时通常不会受到太大影响。然而，如果存在社保缴纳中断、缴费基数不一致等情况，则可能会影响到退休金的计算。
   • 工作年限与退休条件：退休条件通常包括年龄、工作年限等多个方面。如果编制和工资关系不在同一单位，但个人在两个单位的工作年限可以累计计算，且满足退休条件，那么退休时通常不会受到太大影响。然而，如果存在工作年限无法累计、退休条件不符合等情况，则可能会影响到退休的办理。

3. 实际操作建议：

   • 提前了解政策：在退休前，建议提前了解当地政策、单位规定以及个人与单位的协商情况，明确退休金计算、社保缴纳等事项的具体规定。
   • 保留相关证据：保留好与编制、工资关系相关的证据材料，如劳动合同、工资单、社保缴纳记录等，以便在退休时能够证明自己的权益。
   • 咨询专业人士：如果对于退休事宜存在疑问或不确定的地方，建议咨询专业人士或当地社保部门，以获取更准确、更权威的信息和建议。

总结来说，编制和工资关系不在一个单位，退休时是否会有影响，需根据具体情况来判断。建议提前了解政策、保留相关证据，并在有疑问时咨询专业人士或当地社保部门。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。